MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3110935379 · doi:10.1093/neuonc/noaa222.649

PATH-14. GENETIC SUSCEPTIBILITY AND OUTCOMES OF PEDIATRIC, ADOLESCENT AND YOUNG ADULT IDH-MUTANT ASTROCYTOMAS

2020· article· en· W3110935379 sur OpenAlexaff
Miriam Bornhorst, Liana Nobre, Michal Zápotocký, Hayk Barseghyan, Jeremy Goecks, Daniel R. Boué, Uri Tabori, Cynthia Hawkins, Éric Bouffet, Tobey J. MacDonald, Matthew Schniederjan, Alberto Bronischer, Brent A. Orr, David Solomon, Sabine Mueller, Enrico Opocher, Alexander O. Vortmeyer, Asher Marks, Carl Koschmann, Denise Leung, Rajen Mody, Eugene Hwang, Surajit Bhattacharya, Éric Vilain, Joyce Turner, Lindsay Kilburn, Brian R. Rood, Roger J. Packer, Javad Nazarian, Cheng‐Ying Ho

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésATRXMedicineOncologyInternal medicineGermlineIDH1MutationCancerYoung adultCancer researchGeneBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract INTRODUCTION Previously thought to be rare, recent case series have shown that IDH mutations in young patients are more common than previously described. In this study, we analyzed IDH-mutant tumors to determine clinical significance of these mutations in children, adolescents and young adults. METHODS Through this multi-institution study (10 institutions), we collected 64 IDH1/2-mutant infiltrating astrocytoma specimens from 58 patients aged 4–26 (M:F, 0.4:0.6). Specimens included 46 low-grade (LGG) and 18 high-grade (HGG) astrocytomas. Tumor sequencing data (n=45), germline sequencing data (n=37) and outcome data (n=40) was analyzed. RESULTS Similar to adults, most sequenced tumors had a co-mutation in the TP53 gene, while ATRX mutations were less common and primarily seen in HGGs. Approximately 60% (n=21) of patients with germline data available had a mutation in a cancer predisposition gene. Mismatch repair (MMR) mutations were most common (n=12; MSH6 n=9), followed by TP53mutations (n=7). All patients with MMR gene mutations had HGGs and poor progression free (PFS=10% at 2 years, mean TTP=9 months) and overall (OS <30% at 2 years) survival. Despite an OS of 90% at 5 years, many LGG patients had tumor progression/recurrence requiring additional treatment (PFS= 80% at 2 yrs, 40% at 5 yrs, mean TTP=3.5 years). Four LGG tumors (2 with TP53+ATRXloss, 2 with TP53 loss+1p19q co-deletion) underwent malignant transformation. CONCLUSION IDH-mutant tumors in pediatric patients are strongly associated with cancer predisposition and increased risk for progression/recurrence or malignant transformation. Routine screening for IDH1/2 mutations in children with grade 2–4 astrocytomas could greatly impact patient management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeuro-OncologyMême sujetGlioma Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207