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Enregistrement W3110951267 · doi:10.1111/apt.16184

Derivation and validation of a novel method to subgroup patients with functional dyspepsia: beyond upper gastrointestinal symptoms

2020· article· en· W3110951267 sur OpenAlexaffabout
Brigida Barberio, María Inés Pinto-Sánchez, Přemysl Berčík, Ruchit Sood, Edoardo Savarino, Paul Moayyedi, Christopher J. Black, Alexander C. Ford

Notice bibliographique

RevueAlimentary Pharmacology & Therapeutics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastrointestinal motility and disorders
Établissements canadiensMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCohortNauseaInternal medicineLatent class modelCluster (spacecraft)Epigastric painPostprandialCohort studyDepression (economics)Vomiting

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Conventionally, patients with functional dyspepsia are subgrouped based on upper gastrointestinal symptoms, according to the Rome criteria. However, psychological co-morbidity and extraintestinal symptoms are also relevant to functional gastrointestinal disorders. AIM: To investigate whether it is possible to subgroup people with functional dyspepsia using factors beyond upper gastrointestinal symptoms. METHODS: We collected demographic, symptom and psychological health data from adult subjects meeting the Rome III criteria for functional dyspepsia in two secondary care cross-sectional surveys in Canada and the UK. We performed latent class analysis, a method of model-based clustering, to identify specific subgroups (clusters). For each cluster, we drew a radar plot, and compared these by visual inspection, describing cluster characteristics. RESULTS: In total, 400 individuals met Rome III criteria for functional dyspepsia in the Canadian cohort, and 262 the UK cohort. A four-cluster model was the optimum solution and the characteristics of the clusters were almost identical between the two cohorts. The clusters were defined by a pattern of gastrointestinal symptoms and were further differentiated by the extent of extraintestinal and psychological co-morbidity. Cluster 1 (mean age 46.7 years, 66.7% female) consisted of epigastric pain and nausea with high psychological burden, cluster 2 (mean age 41.5 years, 77.7% female) high overall gastrointestinal symptom severity with high psychological burden, cluster 3 (45.8 years, 67.2% female) oesophageal symptoms and early satiety with low psychological burden, and cluster 4 (mean age 40.4 years, 71.5% female) postprandial fullness with low psychological burden. We validated the model derived using the Canadian study population externally by applying it to the UK dataset. We demonstrated reproducibility; it would perform similarly when applied to a different dataset. CONCLUSIONS: Latent class analysis identified four distinct functional dyspepsia subgroups characterised by varying degrees of gastrointestinal symptoms, extraintestinal symptoms and psychological co-morbidity. Further research is needed to assess whether they might be used to direct treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,023
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,067
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,122

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0230,067
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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