Sex‐specific changes in amyloidosis and neuro‐immune modulation in response to alterations in the gut microbiome
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Microglia, resident macrophages of CNS constantly screen the brain and engage in pathological processes by changing their morphology, expressing various antigens and become phagocytic. This activation causes the release of a wave of chemical mediators that promote the neuroinflammatory milieu. Thus, microglial homeostasis represents a highly plastic multifaceted response, finely tuned by the nature of the stimulus and the molecular repertoire involved. Studies from Sisodia lab have shown that antibiotic (ABX) mediated alterations of the gut microbiome in Thy1‐APPSwe.PS1L166Pmice (APPPS1‐21), resulted in a significant decrease in amyloidosis and altered microglial phenotypes in male mice. To investigate the influence of gut microbiome in modulating microglial function in a sex‐specific manner, we generated transgenic mice that would allow us to assess microglial RNA‐Protein networks and address the molecular mechanisms of CNS immunomodulation. Method We generated ‘Thy1‐APP.PS1‐RiboTag’ by crossing APPPS1‐21 mice to RiboTag mice wherein a CD11b promoter drives expression of ribosomal protein L10a (RpL10) that is fused to FLAG/EGFP at the amino‐terminus. Using our established protocol, we altered the microbiome of male and female mice (n=12) by orally gavaging them with ABX from day 14‐21, followed by low dose ABX in drinking water till they are sacrificed (7 wks). Vehicle treated mice were used as controls along with WT‐RiboTag mice. Immunoprecipitation of cortical homogenates with anti‐FLAG was performed to pull‐down actively translated mRNA and proteome in microglia following histopathology. Result We evaluated Aβ pathology and found that ABX‐treatment led to reduced amyloidosis in male mice with no significant changes in the female. Analysis of the mRNAs and the newly synthesized peptides resulted in a snapshot of the dynamic translational state of microglial ribosomes. We observed 21 upregulated and 22 downregulated proteins between the WT‐RiboTag and Th1‐APP.PS1‐RiboTag in male mice and 16 upregulated and 70 downregulated in female. Abx treatment resulted in upregulation of 39 and downregulation of 37 proteins in males while the females showed 51 and 9 respectively. Conclusion We find marked differences in the mRNA and proteins associated with microglial phenotypes expressed in a sex‐specific manner as a function of changes in the gut microbiome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».