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Enregistrement W3111204690 · doi:10.3390/jmse8120998

An Improved Cleaning Protocol for Foraminiferal Calcite from Unconsolidated Core Sediments: HyPerCal—A New Practice for Micropaleontological and Paleoclimatic Proxies

2020· article· en· W3111204690 sur OpenAlexaff
Stergios D. Zarkogiannis, George Kontakiotis, Georgia Gkaniatsa, Venkata S. C. Kuppili, Shashidhara Marathe, Kazimir Wanelik, Vasiliki Lianou, Evanggelia Besiou, Panayiota Makri, Assimina Antonarakou

Notice bibliographique

RevueJournal of Marine Science and Engineering · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueGeology and Paleoclimatology Research
Établissements canadiensCanadian Light Source (Canada)
Organismes subventionnairesDiamond Light Source
Mots-clésCalciteGeologyForaminiferaSeawaterSedimentary rockPaleoceanographyCarbonateBottom waterMineralogyGeochemistryOceanographyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Paleoclimatic and paleoceanographic studies routinely rely on the usage of foraminiferal calcite through faunal, morphometric and physico-chemical proxies. The application of such proxies presupposes the extraction and cleaning of these biomineralized components from ocean sediments in the most efficient way, a process which is often labor intensive and time consuming. In this respect, in this study we performed a systematic experiment for planktonic foraminiferal specimen cleaning using different chemical treatments and evaluated the resulting data of a Late Quaternary gravity core sample from the Aegean Sea. All cleaning procedures adopted here were made on the basis of their minimum potential bias upon foraminiferal proxies, such as the faunal assemblages, degree of fragmentation, stable isotope composition (δ18O and δ13C) and/or Mg/Ca ratios that are frequently used as proxies for surface-ocean climate parameters (e.g., sea surface temperature, sea surface salinity). Six different protocols were tested, involving washing, sieving, and chemical treatment of the samples with hydrogen peroxide and/or sodium hexametaphosphate (Calgon®). Single species foraminifera shell weighing was combined with high-resolution scanning electron microscopy (SEM) and synchrotron X-ray microtomography (SμCT) of the material processed by each of the cleaning protocols, in order to assess the decontamination degree of specimen’s ultrastructure and interior. It appeared that a good compromise between time and cleaning efficiency is the simultaneous treatment of samples with a mixed hydrogen peroxide and Calgon solution, while the most effective way to almost completely decontaminate the calcareous components from undesirable sedimentary material is a two-step treatment—initially with hydrogen peroxide and subsequently with Calgon solutions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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