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Enregistrement W3111390312 · doi:10.3389/fcimb.2020.571088

Genomic Properties and Temporal Analysis of the Interaction of an Invasive Escherichia albertii With Epithelial Cells

2020· article· en· W3111390312 sur OpenAlexaff
Fabiano T. Romão, Fernando H. Martins, Rodrigo T. Hernandes, Tadasuke Ooka, Fernanda Fernandes Santos, Denise Yamamoto, Alexis Bonfim‐Melo, Nina Jones, Tetsuya Hayashi, Waldir P. Elias, Vanessa Sperandio, Tânia A. T. Gomes

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceNational Institutes of HealthConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésIntiminBiologyEffectorBacterial adhesinType three secretion systemMicrobiologyOperonGeneVirulenceSecretionActinCell biologyEscherichia coliGeneticsEnterobacteriaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diarrhea is one of the main causes of infant mortality worldwide, mainly in the developing world. Among the various etiologic agents, Escherichia albertii is emerging as an important human enteropathogen. E. albertii promote attaching and effacing (AE) lesions due to the presence of the locus of enterocyte effacement (LEE) that encodes a type three secretion system (T3SS), the afimbrial adhesin intimin and its translocated receptor, Tir, and several effector proteins. We previously showed that E. albertii strain 1551-2 invades several epithelial cell lineages by a process that is dependent on the intimin-Tir interaction. To understand the contribution of T3SS-dependent effectors present in E. albertii 1551-2 during the invasion process, we performed a genetic analysis of the LEE and non-LEE genes and evaluated the expression of the LEE operons in various stages of bacterial interaction with differentiated intestinal Caco-2 cells. The kinetics of the ability of the 1551-2 strain to colonize and form AE lesions was also investigated in epithelial HeLa cells. We showed that the LEE expression was constant during the early stages of infection but increased at least 4-fold during bacterial persistence in the intracellular compartment. An in silico analysis indicated the presence of a new tccP/espFU subtype, named tccP3. We found that the encoded protein colocalizes with Tir and polymerized F-actin during the infection process in vitro. Moreover, assays performed with Nck null cells demonstrated that the 1551-2 strain can trigger F-actin polymerization in an Nck-independent pathway, despite the fact that TccP3 is not required for this phenotype. Our study highlights the importance of the T3SS during the invasion process and for the maintenance of E. albertii 1551-2 inside the cells. In addition, this work may help to elucidate the versatility of the T3SS for AE pathogens, which are usually considered extracellular and rarely reach the intracellular environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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