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Enregistrement W3111419497 · doi:10.1093/neuonc/noaa222.522

MBRS-01. DISSECTING REGULATORS OF THE ABERRANT POST-TRANSCRIPTIONAL LANDSCAPE IN MYC-AMPLIFIED GROUP 3 MEDULLOBLASTOMA

2020· article· en· W3111419497 sur OpenAlexaff
Michelle Kameda-Smith, Helen He Zhu, En‐Ching Luo, Chitra Venugopal, Agata Xella, Kevin R. Brown, Raymond G. Fox, Brian A. Yee, Sansi Xing, Frederick E. Tan, David Bakhshinyan, Ashley Adile, Minomi Subapanditha, Daniel Picard, Jason Moffat, Adam Fleming, Kristin J. Hope, Provias John, Marc Remke, Yu Lu, Tannishitha Reya, Jüri Reimand, Robert J. Wechsler‐Reya, G Yeo, Sheila K. Singh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaCancer researchOncogeneBiologyContext (archaeology)MediatorGeneComputational biologyGeneticsCell biologyCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Medulloblastoma (MB) is the most common solid malignant pediatric brain neoplasm, with Group 3 (G3) MB representing the most aggressive subgroup. MYC amplification is an independent poor prognostic factor in G3 MB, however, therapeutic targeting of the MYC pathway remains limited and alternative therapies for G3 MB are urgently needed. Here we show that an RNA-binding protein, Musashi-1 (MSI1) is an essential mediator of G3 MB in both MYC-overexpressing mouse models and patient-derived xenografts. Unbiased integrative multi-omics analysis of MSI1 function in human G3 MB suggests a paradigm shift beyond traditional gene-based profiling of oncogenes. Here we identify MSI1 as an oncogene in G3 MB driving stem cell self-renewal through stabilization of HIPK1 mRNA, a downstream context-specific therapeutic target for drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
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