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Enregistrement W3111439742 · doi:10.1093/neuonc/noaa222.560

MBRS-54. POOR SURVIVAL IN REPLICATION REPAIR DEFICIENT HYPERMUTANT MEDULLOBLASTOMA AND CNS EMBRYONAL TUMORS: A REPORT FROM THE INTERNATIONAL RRD CONSORTIUM

2020· article· en· W3111439742 sur OpenAlexaff
Anirban Das, Vanessa Bianchi, Melissa Edwards, Nobish Varghese, Sumedha Sudhaman, Roula Farah, Rina Dvir, Alyssa Reddy, Salmo Raskin, Jordan R. Hansford, Syed Ahmer Hamid, Saunders Hsu, Abed Abu Quider, Mithra Ghalibafian, Elisabeth Koustenis, Abeer Al-Battashi, Gary Mason, Joung Lee, Danille Bell, Duncan Stearns, David S. Ziegler, Michal Zápotocký, Alvaro Lasaletta, Abhaya V. Kulkarni, Derek S. Tsang, Normand Laperrière, Cynthia Hawkins, Éric Bouffet, Vijay Ramaswamy, Uri Tabori

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaCancer researchGermline mutationAtypical teratoid rhabdoid tumorBiologyMedicineMutationInternal medicineOncologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract BACKGROUND Mutations in mismatch repair (MMR) and DNA-polymerase (POL) genes lead to DNA replication repair deficiency (RRD), resulting in a growing group of previously under-recognized childhood brain tumors. Medulloblastoma and embryonal tumors are rarely reported in RRD. Their biological and clinical significance is unknown. METHODS We analyzed the clinical and genomic data of embryonal tumors registered in the International RRD Consortium. RESULTS Twenty-six tumors were centrally reviewed to confirm medulloblastoma (n=18), embryonal-tumor, NOS (n=5), and three glioblastoma (excluded). Embryonal tumors were observed at a young age (median: 7-years, IQR: 5;11), and all but one exhibited clinical cues (café-au-lait macules/ family history) of germline RRD. Medulloblastomas with RRD exhibited high-risk features, including anaplastic histology (50%), and SHH-subgroup with TP53-mutation (50%). Importantly, 68% harbored POLE/POLD1 mutations, resulting in median tumor mutation burden of 164 mut/mb. POL-mutated tumors were significantly ultra-hypermutated (>100 mut/mb) than tumors with MMR-deficiency alone (p=0.015). Synchronous and metachronous tumors were observed in 40%. However 90% of the deaths were related to the diagnosis of embryonal CNS tumor. Median survival for the entire cohort was 17-months (95% CI: 10 to 23). Predicted 3-year survival was 37% for medulloblastoma, with no survivors among other embryonal tumors. CONCLUSIONS This is the largest cohort of replication repair deficient medulloblastoma reported till date. The tumors are hypermutated, harbor somatic mutations in TP53 and/or POLE/POLD1, and have very poor survival with current chemo-irradiation based approaches. These biologically unique tumors expand the spectrum of high-risk TP53-mutant SHH-medulloblastoma, and need novel strategies for treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,324
Score d'incertitude au seuil0,515

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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