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Enregistrement W3111571276 · doi:10.1074/jbc.ra120.016565

An imbalanced ratio between PC(16:0/16:0) and LPC(16:0) revealed by lipidomics supports the role of the Lands cycle in ischemic brain injury

2020· article· en· W3111571276 sur OpenAlexaff
Lifeng Zheng, Chengbin Xie, Ju Zheng, Qiangrui Dong, Tengxiao Si, Jing Zhang, Sheng‐Tao Hou

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésLipidomicsLysophosphatidylcholineChemistryNeuroprotectionPhosphatidylcholinePharmacologyInternal medicineMedicinePhospholipidBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Promoting brain recovery after stroke is challenging as a plethora of inhibitory molecules are produced in the brain preventing it from full healing. Moreover, the full scope of inhibitory molecules produced is not well understood. Here, using a high-sensitivity UPLC-MS-based shotgun lipidomics strategy, we semiquantitively measured the differential lipid contents in the mouse cerebral cortex recovering from a transient middle cerebral artery occlusion (MCAO). The lipidomic data were interrogated using the soft independent modeling of class analogy (SIMCA) method involving principal component analysis (PCA) and orthogonal partial least squares discriminant analysis (OPLS-DA). Statistics of the 578 confirmed lipids revealed 84 species were differentially changed during MCAO/reperfusion. The most dynamic changes in lipids occurred between 1 and 7 days post-MCAO, whereas concentrations had subsided to the Sham group level at 14 and 28 days post-MCAO. Quantitative analyses revealed a strong monotonic relationship between the reduction in phosphatidylcholine (PC)(16:0/16:0) and the increase in lysophosphatidylcholine (LPC)(16:0) levels (Spearman's Rs = -0.86) during the 1 to 7 days reperfusion period. Inhibition of cPLA2 prevented changes in the ratio between PC(16:0/16:0) and LPC(16:0), indicating altered Land's cycle of PC. A series of in vitro studies showed that LPC(16:0), but not PC(16:0/16:0), was detrimental to the integrity of neuronal growth cones and neuronal viability through evoking intracellular calcium influx. In contrast, PC(16:0/16:0) significantly suppressed microglial secretion of IL-1β and TNF-α, limiting neuroinflammation pathways. Together, these data support the role of the imbalanced ratio between PC(16:0/16:0) and LPC(16:0), maintained by Lands' cycle, in neuronal damage and microglia-mediated inflammatory response during ischemic recovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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