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Enregistrement W3111606591 · doi:10.1111/jfb.14650

Valid oxygen uptake measurements: using high <i>r</i><sup>2</sup> values with good intentions can bias upward the determination of standard metabolic rate

2020· article· en· W3111606591 sur OpenAlexafffund
Denis Chabot, Yangfan Zhang, Anthony P. Farrell

Notice bibliographique

RevueJournal of Fish Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans CanadaCanada Excellence Research Chairs, Government of Canada
Mots-clésSmoothingRespirometerFunction (biology)Linear relationshipStatisticsSIGNAL (programming language)Plot (graphics)Fish <Actinopterygii>Noise (video)MathematicsMetabolic rateStandard errorOxygenBiological systemAnalytical Chemistry (journal)BiologyEnvironmental chemistryComputer scienceChemistryFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This analysis shows good intentions in the selection of valid and precise oxygen uptake ( O 2 ) measurements by retaining only slopes of declining dissolved oxygen level in a respirometer that have very high values of the coefficient of determination, r 2 , are not always successful at excluding nonlinear slopes. Much worse, by potentially removing linear slopes that have low r 2 only because of a low signal‐to‐noise ratio, this procedure can overestimate the calculation of standard metabolic rate (SMR) of the fish. To remedy this possibility, a few simple diagnostic tools are demonstrated to assess the appropriateness of a given minimum acceptable r 2 , such as calculating the proportion of rejected O 2 determinations, producing a histogram of the r 2 values and a plot of r 2 as a function of O 2 . The authors offer solutions for cases when many linear slopes have low r 2 . The least satisfactory but easiest to implement is lowering the minimum acceptable r 2 . More satisfactory solutions involve processing (smoothing) the raw signal of dissolved oxygen as a function of time to improve the signal‐to‐noise ratio and the r 2 s.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,402
Score d'incertitude au seuil0,240

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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