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Enregistrement W3111626025 · doi:10.3389/fmolb.2020.559688

Fetal Metabolomic Alterations Following Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Infection

2020· article· en· W3111626025 sur OpenAlexafffund
Carolina Maciel Malgarin, Daniel J. MacPhee, John C. S. Harding

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Biosciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesGenome PrairieGenome AlbertaUniversity of AlbertaMinistry of Agriculture - SaskatchewanGenome Canada
Mots-clésFetusMetabolomePorcine reproductive and respiratory syndrome virusBiologyPhysiologyAndrologyArterivirusImmunologyMetabolomicsPregnancyDiseaseInternal medicineVirusMedicineBioinformaticsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PRRSV infection in third-trimester pregnant sows can lead to fetal death and abortions, although the mechanisms triggering these effects are not well understood. Since resistant and susceptible fetuses can coexist in the same litter, we propose that there may be differential mechanisms used by some fetuses to evade infection and/or disease progression. Our objectives were to investigate possible differences in the metabolome of PRRSV-infected and non-infected fetuses, as well as the interaction of altered intrauterine growth development and PRRSV infection to elucidate possible causes of fetal death following PRRSV infection. Near-term serum samples collected from fetuses on gestation day 106, 21 days post PRRSV-2 infection, were processed by direct flow injection mass spectrometry (DI-MS) and nuclear magnetic resonance (NMR) techniques. Experiment one investigated disease progression with 24 fetuses selected from each of four phenotypic groups: fetuses from non-inoculated gilts (CTRL); fetuses from inoculated gilts that escaped infection (UNINF); infected high viral load viable fetuses (INF); and infected high viral load meconium-stained fetuses (MEC). Experiment two investigated the interaction of intrauterine growth retardation (IUGR) and PRRSV infection by analyzing differences among: non-infected normal development (CON-N); CON-IUGR; PRRS infected normal development (PRRS-N); and PRRS-IUGR. Univariate and multivariate (PCA, PLS-DA) statistics determined group differences among various contrasts, and the most important metabolites associated with disease progression and fetal development. Significant differences in the metabolome were observed, especially between PRRSV-negative fetuses (CTRL and UNINF) and MEC fetuses, while INF fetuses appear to span both groups. The two metabolites with highest variable importance in projection (VIP) scores related to disease progression were alpha-aminoadipic acid (alpha-AAA) and kynurenine (KYN), having the highest concentration in MEC and INF fetuses, respectively, compared to CTRL and UNINF. In experiment two, non-IUGR fetuses were found to have increased levels of lysoPCs, PCs and amino acids compared to IUGR fetuses, while the near complete absence of lysoPCs and PCs in IUGR fetuses, even during infection, indicate a distinctive response to infection compared to non-growth retarded fetuses. Possible markers of PRRSV fetal susceptibility, such as alpha-AAA, kynurenine and lysoPCs, are presented and discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,710
Score d'incertitude au seuil0,279

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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