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Enregistrement W3111833482 · doi:10.3389/fnins.2020.598868

Cortical Thickness Estimation in Individuals With Cerebral Small Vessel Disease, Focal Atrophy, and Chronic Stroke Lesions

2020· article· en· W3111833482 sur OpenAlexafffundabout
Miracle Ozzoude, Joel Ramirez, Pradeep Reddy Raamana, Melissa F. Holmes, Kirstin Walker, Christopher J.M. Scott, Fuqiang Gao, Maged Goubran, Donna Kwan, Maria Carmela Tartaglia, Derek Beaton, Gustavo Saposnik, Ayman Hassan, Jane M. Lawrence‐Dewar, Dar Dowlatshahi, Stephen C. Strother, Sean Symons, Robert Bartha, Richard H. Swartz, Sandra E. Black

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neuroscience · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensSunnybrook Health Science CentreSt. Michael's HospitalHealth Sciences CentreUniversity Health NetworkOccupational Cancer Research CentreOttawa HospitalToronto Western HospitalWestern UniversityUniversity of TorontoThunder Bay Regional Research InstituteQueen's UniversityUniversity of OttawaBaycrest Hospital
Organismes subventionnairesFaculty of Health Sciences, Queen's UniversityLondon Health Sciences FoundationQueen's UniversityCentre for Addiction and Mental Health FoundationMcMaster UniversityTemerty Family FoundationUniversity of OttawaOntario Brain InstituteGovernment of Ontario
Mots-clésNeurovascular bundleAtrophyStroke (engine)MedicineNeuroimagingMagnetic resonance imagingMontreal Cognitive AssessmentCognitive declineCognitionSegmentationWhite matterDiseaseCardiologyInternal medicinePathologyCognitive impairmentRadiologyDementiaPsychiatryArtificial intelligenceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Regional changes to cortical thickness in individuals with neurodegenerative and cerebrovascular diseases (CVD) can be estimated using specialized neuroimaging software. However, the presence of cerebral small vessel disease, focal atrophy, and cortico-subcortical stroke lesions, pose significant challenges that increase the likelihood of misclassification errors and segmentation failures. Purpose The main goal of this study was to examine a correction procedure developed for enhancing FreeSurfer’s (FS’s) cortical thickness estimation tool, particularly when applied to the most challenging MRI obtained from participants with chronic stroke and CVD, with varying degrees of neurovascular lesions and brain atrophy. Methods In 155 CVD participants enrolled in the Ontario Neurodegenerative Disease Research Initiative (ONDRI), FS outputs were compared between a fully automated, unmodified procedure and a corrected procedure that accounted for potential sources of error due to atrophy and neurovascular lesions. Quality control (QC) measures were obtained from both procedures. Association between cortical thickness and global cognitive status as assessed by the Montreal Cognitive Assessment (MoCA) score was also investigated from both procedures. Results Corrected procedures increased “Acceptable” QC ratings from 18 to 76% for the cortical ribbon and from 38 to 92% for tissue segmentation. Corrected procedures reduced “Fail” ratings from 11 to 0% for the cortical ribbon and 62 to 8% for tissue segmentation. FS-based segmentation of T1-weighted white matter hypointensities were significantly greater in the corrected procedure (5.8 mL vs. 15.9 mL, p < 0.001). The unmodified procedure yielded no significant associations with global cognitive status, whereas the corrected procedure yielded positive associations between MoCA total score and clusters of cortical thickness in the left superior parietal ( p = 0.018) and left insula ( p = 0.04) regions. Further analyses with the corrected cortical thickness results and MoCA subscores showed a positive association between left superior parietal cortical thickness and Attention ( p < 0.001). Conclusion These findings suggest that correction procedures which account for brain atrophy and neurovascular lesions can significantly improve FS’s segmentation results and reduce failure rates, thus maximizing power by preventing the loss of our important study participants. Future work will examine relationships between cortical thickness, cerebral small vessel disease, and cognitive dysfunction due to neurodegenerative disease in the ONDRI study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,089
Score d'incertitude au seuil0,388

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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