MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3111940417 · doi:10.1016/j.cris.2020.100006

Rhodnius prolixus uses the peptidoglycan recognition receptor rpPGRP-LC/LA to detect Gram-negative bacteria and activate the IMD pathway

2020· article· en· W3111940417 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCurrent Research in Insect Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsSimon Fraser University
Mots-clésBiologyPattern recognition receptorRhodnius prolixusPeptidoglycanInnate immune systemDrosophila melanogasterTrypanosoma cruziMicrobiologyAntimicrobial peptidesGeneticsCell biologyGeneImmune systemInsectBacteriaParasite hostingBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Insects rely on an innate immune system to recognize and eliminate pathogens. Key components of this system are highly conserved across all invertebrates. To detect pathogens, insects use Pattern recognition receptors (PRRs) that bind to signature motifs on the surface of pathogens called Pathogen Associated Molecular Patterns (PAMPs). In general, insects use peptidoglycan recognition proteins (PGRPs) in the Immune Deficiency (IMD) pathway to detect Gram-negative bacteria, and other PGRPs and Gram-negative binding proteins (GNBPs) in the Toll pathway to detect Gram-positive bacteria and fungi, although there is crosstalk and cooperation between these and other pathways. Once pathogens are recognized, these pathways activate the production of potent antimicrobial peptides (AMPs). Most PRRs in insects have been reported from genome sequencing initiatives but few have been characterized functionally. The initial studies on insect PRRs were done using established dipteran model organisms such as Drosophila melanogaster, but there are differences in the numbers and functional role of PRRs in different insects. Here we describe the genomic repertoire of PGRPs in Rhodnius prolixus, a hemimetabolous hemipteran vector of the parasite Trypanosoma cruzi that causes Chagas disease in humans. Using a de novo transcriptome from the fat body of immune activated insects, we found 5 genes encoding PGRPs. Phylogenetic analysis groups R. prolixus PGRPs with D. melanogaster PGRP-LA, which is involved in the IMD pathway in the respiratory tract. A single R. prolixus PGRP gene encodes isoforms that contain an intracellular region or motif (cryptic RIP Homotypic Interaction Motif-cRHIM) that is involved in the IMD signaling pathway in D. melanogaster. We characterized and silenced this gene using RNAi and show that the PGRPs that contain cRHIMs are involved in the recognition of Gram-negative bacteria, and activation of the IMD pathway in the fat body of R. prolixus, similar to the PGRP-LC of D. melanogaster. This is the first functional characterization of a PGRP containing a cRHIM motif that serves to activate the IMD pathway in a hemimetabolous insect.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,949

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,169
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle