MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3111973725 · doi:10.5423/ppj.oa.07.2020.0127

In Vitro Wheat Immature Spike Culture Screening Identified Fusarium Head Blight Resistance in Wheat Spike Cultured Derived Variants and in the Progeny of Their Crosses with an Elite Cultivar

2020· article· en· W3111973725 sur OpenAlexafffundabout
Chen Huang, Manu P. Gangola, H. R. Kutcher, Pierre Hucl, S. Ganeshan, Ravindra N. Chibbar

Notice bibliographique

RevueThe Plant Pathology Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesSaskatchewan Wheat Development CommissionChina Scholarship CouncilAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésGermplasmBiologyFusariumPlant disease resistanceGenotypingMycotoxinCultivarAllelePoaceaeGenotypeHorticultureVeterinary medicineAgronomyBotanyGeneticsGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium head blight (FHB) is a devastating fungal disease of wheat (Triticum aestivum L.).The lack of genetic resources with stable FHB resistance combined with a reliable and rapid screening method to evaluate FHB resistance is a major limitation to the development of FHB resistant wheat germplasm.The present study utilized an immature wheat spike culture method to screen wheat spike culture derived variants (SCDV) for FHB resistance.Mycotoxin concentrations determined by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) correlated significantly (P < 0.01) with FHB severity and disease progression during in vitro spike culture.Selected SCDV lines assessed for FHB resistance in a Fusarium field disease nursery in Carman, Manitoba, Canada in 2016 showed significant (P < 0.01) correlation of disease severity to the in vitro spike culture screening method.Selected resistant SCDV lines were also crossed with an elite cv.CDC Hughes and the progeny of F 2 and BC 1 F 2 were screened by high resolution melt curve (HRM) analyses for the wheat UDPglucosyl transferase gene (TaUGT-3B) single nucleotide polymorphism to identify resistant (T-allele) and susceptible (G-allele) markers.The progeny from the crosses were also screened for FHB severity using the immature spike culture method and identified resistant progeny grouped according to the HRM genotyping data.The results demonstrate a reliable approach using the immature spike culture to screen for FHB resistance in progeny of crosses in early stage of breeding programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Plant Pathology JournalMême sujetMycotoxins in Agriculture and FoodTravaux en français237 207