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Enregistrement W3111997437 · doi:10.3138/jammi-2020-0024

Toxoplasmosis, cryptosporidiosis, and isosporiasis in HIV-negative immunocompromised patients: A single-centre study, Ottawa, Ontario, Canada

2020· article· en· W3111997437 sur OpenAlexaffvenueabout
Chloé Thabet, Adeel Sherazi, Juthaporn Cowan

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensOttawa HospitalInstitute of Infection and ImmunityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunosuppressionToxoplasmosisIsosporaMedicineCryptosporidiumMalignancyOpportunistic infectionTransplantationImmunologyInternal medicinePediatricsHuman immunodeficiency virus (HIV)BiologyViral disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Historically, patients with HIV have been at the highest risk of infection with opportunistic protozoans such as Toxoplasma, Cryptosporidium, and Isospora. Among patients with HIV who are compliant with antiretroviral therapy, the likelihood of acquiring an opportunistic infection is low. The risk of infection is harder to mitigate in the growing number of HIV-negative immunodeficient patients, such as people with hematological malignancies or those who are post-transplantation. Methods: We conducted a retrospective case series of patients with documented Toxoplasma infections between 2008 and 2017 and with Cryptosporidium and Isospora infections between 2014 and 2017 at the Ottawa Hospital. Results: During the study period, there were 10 confirmed cases of toxoplasmosis, 20 cases of cryptosporidiosis, and 2 cases of isosporiasis. Cryptosporidiosis (95%) and toxoplasmosis (60%) occurred more frequently among HIV-negative patients, whereas isosporiasis cases were limited to HIV-positive patients. Among patients with cryptosporidiosis, the most common underlying cause of immunosuppression in HIV-negative individuals was solid organ transplantation (15.79%), followed by diabetes (10.53%), end-stage renal disease (5.26%), and hematologic malignancy (5.26%). Seventy percent of patients had no known cause of immunosuppression. The most common underlying condition associated with toxoplasmosis was hematological malignancy (50%), followed by solid organ transplantation (33.33%), and solid tumours (16.66%). Conclusions: This study’s results suggest that Cryptosporidium infections are more common among immunocompetent patients in Ottawa, whereas Toxoplasma infections are more common among HIV-negative patients with acquired immunodeficiencies. As the demographics of immunocompromised individuals continue to evolve, screening for protozoal infections in high-risk populations may become clinically important.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,133

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0050,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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