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Enregistrement W3112068339 · doi:10.1093/neuonc/noaa222.733

RARE-22. GERMLINE PATHOGENIC VARIANT c.1552G>A;p.E518K IN DGCR8 CONFERS SUSCEPTIBILITY FOR SCHWANNOMATOSIS AND THYROID TUMORS

2020· article· en· W3112068339 sur OpenAlexaff
Anne‐Sophie Chong, Javad Nadaf, Èlia Grau, María Apellániz-Ruiz, Somayyeh Fahiminiya, Avi Saskin, HyeRim Han, Robert Turcotte, Karl Muchantef, Christian Thomas, Rabea Wagener, Angelia V. Bassenden, Özgür Mete, Marc Pusztaszeri, Werner Paulus, Albert M. Berghuis, Reiner Siebert, Steffen Albrecht, Martin Hasselblatt, Conxi Lázaro, Alexander Teule, Marc R. Fabian, Joan Brunet, William D. Foulkes, Bárbara Rivera

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversity of TorontoJewish General HospitalUniversity Health NetworkMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGermlineGermline mutationSchwannomaBiologyCancer researchThyroid cancerSomatic cellWilms' tumorSMARCB1ThyroidPathologyMedicineMutationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Germline mutations in DICER1 cause a pleiotropic susceptibility syndrome characterized by the development of pediatric or early-onset tumors including pleuropulmonary blastoma, Wilms tumors, pineoblastomas, multinodular goiter (MNG) and thyroid cancers. Somatic mutations in the other two microprocessors DROSHA and DGCR8 have been found in Wilms Tumors and pineoblastomas. We present here two families with peripheral schwannomatosis and thyroid tumors carrying a germline variant c.1552G>A;p.E518K in DGCR8. Family one had six affected members with early-onset MNG and five of them developed schwannomatosis. All five members were heterozygous for the variant. One of the carriers had also been diagnosed with a choroid plexus papilloma at 7 years old. The common second event in all tumors tested was the loss of chromosome 22 at the somatic level. In family two, a 35-year-old male was diagnosed with a peripheral schwannoma at the age of 12. Since then, he has developed seven extra peripheral schwannomas (one of which was an ancient schwannoma) and papillary thyroid cancer. DGCR8 lies on chromosome 22q, adjacent to the three schwannoma genes: LZTR1, SMARCB1 and NF2. The variant, c.1552G>A;p.E518K localizes to the first RNA-binding domain of DGCR8 and structural modelling predicts that it abolishes proper binding of RNA. It is also a hotspot somatic mutation in Wilms tumors. Using miRNA profiling, we show that this variant disrupts global microRNA production and DGCR8 mutated tumors show a specific miRNA profile different from DGCR8 wild type tumors. These findings reinforce DGCR8 as a novel susceptibility gene for schwannomatosis and thyroid tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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