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Enregistrement W3112092578 · doi:10.1002/cem.3315

A pilot study on parallel factor analysis as a diagnostic tool for oral cancer diagnosis: A statistical modeling approach

2020· article· en· W3112092578 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Chemometrics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueSpectroscopy and Chemometric Analyses
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlavin adenine dinucleotideNicotinamide adenine dinucleotideLinear discriminant analysisCancerChemistryPathologyMedicineBiochemistryInternal medicineMathematicsStatisticsCofactorEnzymeNAD+ kinase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Excitation‐emission matrix (EEM) has been extensively used as the comprehensive diagnostic tool to extract the biochemical fingerprint of the intrinsic fluorophores in a single scan window. However, there is a gap between the rigorous applications of the statistical tool with respect to discrimination of different stages of the disease which has been the subject for many years. Parallel factor analysis (PARAFAC) is one among the powerful statistical modeling approaches among others. In the present study, a total of 70 EEM matrices of normal, premalignant, and malignant oral tissues were given as a input, and seven intrinsic fluorophores were extracted as “components.” The extracted components were well correlated with respect to the appropriate excitation and emission spectral characteristics of the multiple intrinsic fluorophores such as tryptophan, flavin adenine dinucleotide (FAD), nicotinamide adenine dinucleotide (NADH), collagen‐1, porphyrin, tyrosine, and collagen. Subsequently, the student's t test and linear discriminant analysis (LDA) have been carried out with respect to the fluorescence intensity scores between normal vs. premalignant, normal vs. cancer, and premalignant vs. malignant groups. In normal vs. premalignant, all the seven fluorophores exhibit good statistical accuracy except porphyrin; normal vs. cancer exhibits higher statistical significance for tryptophan, NADH, and FAD than rest of the fluorophores, and premalignant vs. malignant shows proper classification in discriminating FAD, collagen‐1, and collagen. In summary, based on positive predictive value, the normal vs. premalignant exhibits 100% classification than the other two groups. Hence, the PARAFAC analysis could be the alternative and useful diagnostic tool in oral cancer diagnosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,754
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,006
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,119
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle