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Enregistrement W3112252398 · doi:10.1093/neuonc/noaa215.976

TMOD-26. ESTABLISHING A PATIENT-DERIVED, IN-VITRO ORGANOTYPIC SLICE CULTURE MODEL OF GBM

2020· article· en· W3112252398 sur OpenAlexaff
Liam Rappoldt, Adrienne Weeks, Rodney Ouellete, Jeremy Roy, Cathy Taylor, Craig McCormick, Kathleen M. Attwood, Inhwa Kim

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensAtlantic Cancer Research InstituteDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlow cytometryCell cultureViral vectorWestern blotTransduction (biophysics)GlioblastomaCancer researchLentivirusU87Confocal microscopyConfocalIn vitroBiologyCell biologyPathologyMolecular biologyMedicineImmunologyHuman immunodeficiency virus (HIV)BiophysicsGeneticsGenePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glioblastoma Multiforme (GBM) is the most common primary malignant brain tumour. This tumour is universally fatal with a median survival of 15 months. Driving this pathology is an extremely heterogeneic tumour and complex tumour microenvironment. GBM research is primarily conducted using immortalized or primary cell lines due to their practicality and reproducibility. However, these cell lines do not effectively recapitulate the tumour microenvironment. Mouse models address these shortcomings but are laborious and expensive. We propose to utilize a patient derived organotypic culture model of GBM as an intermediary. We have utilized this model to test genetic manipulation via lentiviral transduction and the feasibility of utilizing this model to understand patient derived extracellular vesicles (EVs). We have sectioned and cultured patient derived organotypic models for 14 days without loss of viability. To determine if these organotypic cultures are amenable to lentiviral manipulation, tissue sections were transduced with far-red fluorescent lentivirus and efficiency determined by confocal laser scanning microscopy (CLSM) and flow cytometry (FC). To determine feasibility as a model for EVs, media obtained from patient-derived organotypic cultures was analyzed by western blot, nanoparticle tracking analysis (NTA), and nanoFlow Cytometry (nFC). In the future these EVs will be compared to those found in patient serum. The model of GBM has been lentivirally transduced to express a far-red fluorescent vector in approximately 15% of the slice, quantified by CLSM and FC. EV-sized particles positive for canonical EV markers have been identified in the media by NTA, nFC and western blot. Using lentiviral-mediated genetic engineering and emerging EV science, this organotypic slice culture models yields exciting utility in GBM research. The established organotypic slice culture model will likely be a valuable tool in the study of GBM biology and EV dynamics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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