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Enregistrement W3112296607 · doi:10.1093/neuonc/noaa215.962

TMOD-11. APPLICATION OF A NOVEL TRANSGENIC AND SYNGENEIC MOUSE MODELS OF HUMAN CLASSICAL GLIOBLASTOMA FOR DRUG SCREENING AND PRE-CLINICAL TRIALS

2020· article· en· W3112296607 sur OpenAlexaff
Olivia Singh, Mathew Voisin, Mira Li, Shirin Karimi, Kanwalpreet Walia, Hafsah Ali, Farshad Nassiri, Suganth Suppiah, Kenneth Aldape, Qingxia Wei, Gelareh Zadeh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchCDKN2ABiologyGenetically modified mouseEpigeneticsTransgenePathologyMedicineCancerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glioblastoma multiforme (GBM) is the most common malignant brain tumor in adults with 1 year median survival. The classical subtype of GBM occurs in about 10% of GBM cases and has the worst clinical outcome. The most frequent genetic alteration associated with classical GBM is amplification in the epidermal growth factor receptor (EGFR) and homozygous deletion in CDKN2A (Cyclin Dependent Kinase Inhibitor 2A). We generated a transgenic mouse harboring EGFRvIII, a constitutively active mutant of EGFR, knock in and homozygous deletion in p19 ARF, an alternative spliced form of the CDKN2a gene, restricted to glial cells. Transgenic mice develop tumors as early as 1 month and 73% of mice die by 6 months of age. MRIs reveal that mice develop infiltrative tumor cells throughout the brain and craniospinal junction with some infiltration within the leptomeninges that can result in hydrocephalus. Histology shows that 72% of tumors are high grade gliomas and some tumors demonstrate classical histological features of human GBM such as pseudopallisading necrosis, hyper vascularity and cellular atypia. We generated primary cell lines from transgenic mice that retained EGFRVIII expression and P19 ARF deletion and formed allografts in syngeneic mouse brains. Epigenetic modifications are considered a key mechanism in GBM development. We have therefore evaluated the efficacy of a panel of 42 compounds that target various epigenetic proteins including the readers, writers, and editors of several histone marks available from the Structural Genomics Consortium in primary cell lines derived from our mouse model. The primary cell lines were exposed to epigenetic drugs showing different responses to the same epigenetic modifiers. Key candidate drugs will further be tested pre-clinically in our syngeneic mouse model. In summary, we developed a novel transgenic and syngeneic mouse model for human classical GBM that can be used for drug screening and pre-clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,145
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
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