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Enregistrement W3112358011 · doi:10.1038/s41375-020-01100-5

Value of flow cytometry for MRD-based relapse prediction in B-cell precursor ALL in a multicenter setting

2020· article· en· W3112358011 sur OpenAlexaff
Signe Modvig, Heléne Hallböök, Hans O. Madsen, Sanna Siitonen, Susanne Rosthøj, Anne Tierens, Vesa Juvonen, Liv Osnes, Helen Vålerhaugen, Magnus Hultdin, Rėda Matuzevičienė, Mindaugas Stoškus, Millaray Marincevic, Aili Lilleorg, Mats Ehinger, Ulrika Norén‐Nyström, N. Toft, Mervi Taskinen, Ólafur G. Jónsson, Kaie Pruunsild, Goda Vaitkevičienė, Kim Vettenranta, Bendik Lund, Jonas Abrahamsson, Anna Porwit, Kjeld Schmiegelow, Hanne Vibeke Marquart

Notice bibliographique

RevueLeukemia · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Lymphoblastic Leukemia research
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlow cytometryValue (mathematics)OncologyInternal medicineMedicinePredictive valueCancer researchImmunologyStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract PCR of TCR/Ig gene rearrangements is considered the method of choice for minimal residual disease (MRD) quantification in BCP-ALL, but flow cytometry analysis of leukemia-associated immunophenotypes (FCM-MRD) is faster and biologically more informative. FCM-MRD performed in 18 laboratories across seven countries was used for risk stratification of 1487 patients with BCP-ALL enrolled in the NOPHO ALL2008 protocol. When no informative FCM-marker was available, risk stratification was based on real-time quantitative PCR. An informative FCM-marker was found in 96.2% and only two patients (0.14%) had non-informative FCM and non-informative PCR-markers. The overall 5-year event-free survival was 86.1% with a cumulative incidence of relapse (CIR 5y ) of 9.5%. FCM-MRD levels on days 15 (HzR 4.0, p < 0.0001), 29 (HzR 2.7, p < 0.0001), and 79 (HzR 3.5, p < 0.0001) associated with hazard of relapse adjusted for age, cytogenetics, and WBC. The early (day 15) response associated with CIR 5y adjusted for day 29 FCM-MRD, with higher levels in adults (median 2.4 × 10 −2 versus 5.2 × 10 −3 , p < 0.0001). Undetectable FCM- and/or PCR-MRD on day 29 identified patients with a very good outcome (CIR 5y = 3.2%). For patients who did not undergo transplantation, day 79 FCM-MRD > 10 −4 associated with a CIR 5y = 22.1%. In conclusion, FCM-MRD performed in a multicenter setting is a clinically useful method for MRD-based treatment stratification in BCP-ALL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,855
Score d'incertitude au seuil0,762

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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