MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3112732395 · doi:10.1002/alz.047209

International initiative for harmonization of cerebrospinal fluid diagnostic comments in Alzheimer's disease

2020· article· en· W3112732395 sur OpenAlexaffabout
Constance Delaby, Charlotte E. Teunissen, Daniel Alcolea, Élodie Bouaziz-Amar, Anne Beaume, Aurélie Bedel, Edith Bigot‐Corbel, Maria Bjerke, Marie‐Céline Blanc, Olivier Bousiges, Miles Chapman, Mari L. DeMarco, Mara D’Onofrio, Diane Dufour‐Rainfray, Sebastiaan Engelborghs, Hermann Esselmann, Anne Fogli, Elisabetta Galloni, Clémentine Gondolf, Frédérique Grandhomme, Oriol Grau‐Rivera, Melanie Hart, Andreas Jeromin, Ashvini Keshavan, Michael Khalil, Pèter Köertvelyessy, Agnieszka Kulczyńska‐Przybik, Jean Laplanche, Alberto Lleó, Catherine Malaplate, Barbara Mroszko, Léonor Nogueira, Adelina Orellana, Markus Otto, Jean‐Baptiste Oudart, Claire Paquet, Lucilla Parnetti, Armand Perret‐Liaudet, Katell Poec, Koen Poesen, Albert Puig‐Pijoan, Isabelle Quadrio, Muriel Quillard‐Muraine, Benoît Rucheton, Susanna Schraen, Marc Suárez‐Calvet, Magda Tsolaki, Hayrettin Tumani, Chinedu Udeh‐Momoh, Lucie Vaudran, Marcel M. Verbeek, Federico Verde, Lisa Vermunt, Jonathan Vogelgsang, Jens Wiltfang, Henrik Zetterberg, Sylvain Lehmann

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalProvidence Health Care
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHarmonizationDementiaMedicineGuidelineDiseaseCerebrospinal fluidClinical PracticeFamily medicineMemory clinicTask forcePathologyPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The quantification of cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers (Abeta peptides [Ab1‐40 and Ab1‐42], tau protein and its phosphorylated form phospho‐tau) is progressively implemented in laboratories as an aid for the multidisciplinary diagnosis of Alzheimer disease (AD), DeKosky ST, Alz dementia, 2011, PMID: 21322828 . However, no consensus has been defined among the different laboratories involved to adapt the conclusions/comments to the level of quantified CSF biomarkers. As a result, although the analytical methods for such quantification may be similar across the laboratories involved in this clinical task, the conclusions transmitted to the physician in charge (neurologist or psychiatrist) may be quite different. Harmonization of this report is thus necessary so patients’ care and research stratification can be similar wherever the analysis is performed. Method A total of 34 laboratories (involved in CSF biomarkers measurement) across the world accepted to be part of our project of diagnostic’s comments harmonization (represented countries: Austria, Belgium, Canada, France, Germany, Italy, Netherland, Poland, Spain, Sweden, United Kingdom, USA). As a first step, we defined the 9 most typical biochemical profiles, according to the level of CSF biomarkers and their combination. For each profile, each laboratory was asked to provide us with the comments/conclusions given in routine clinical practice. We then collected and pooled all the comments in a common file, so that the laboratories could, as a second step, choose and order three of these comments (for each biochemical profile defined), according to their reliability in clinical practice. Result We are currently analysing the second step‐answers of the laboratories, in order to define a consensual pattern of comments and conclusions that could be implemented in all the laboratories involved in the biochemical diagnosis of AD. Obtained data will be presented. Conclusion The discrepancies of the comments for AD biochemical diagnosis across laboratories worldwide can be confusing and it is of strong importance to harmonize them (according to the level of quantified biomarkers and other information likely available such as the age, APOE genotype...). Our initiative will likely provide such harmonized pattern of comments/conclusions, thus ensuring equal care of patients across the different diagnostic centres.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,321
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,259
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,321
Score d'incertitude au seuil0,837

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3210,259
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0170,016
Études des sciences et des technologies0,0030,004
Communication savante0,0070,004
Science ouverte0,0110,014
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAlzheimer s & Dementia→Même sujetAlzheimer's disease research and treatments→Travaux en français237 207→