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Enregistrement W3112768480 · doi:10.1093/jnci/djaa178

Comparing 5-Year and Lifetime Risks of Breast Cancer using the Prospective Family Study Cohort

2020· article· en· W3112768480 sur OpenAlexaff
Robert J. MacInnis, Julia A. Knight, Wendy K. Chung, Roger L. Milne, Alice S. Whittemore, Richard Buchsbaum, Yuyan Liao, Nur Zeinomar, Gillian S. Dite, Melissa C. Southey, David E. Goldgar, Graham G. Giles, Allison W. Kurian, Irene L. Andrulis, Esther M. John, Mary B. Daly, Saundra S. Buys, Kelly‐Anne Phillips, John L. Hopper, Mary Beth Terry

Notice bibliographique

RevueJNCI Journal of the National Cancer Institute · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensSinai Health SystemLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteCancer Council Western AustraliaCancer AustraliaNational Breast Cancer FoundationMedical Research CouncilVicHealthNational Health and Medical Research CouncilBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésIbisBreast cancerMedicineConfidence intervalProspective cohort studyRisk assessmentCohort studyReceiver operating characteristicDemographyCohortIncidence (geometry)GynecologyObstetricsCancerInternal medicineMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Clinical guidelines often use predicted lifetime risk from birth to define criteria for making decisions regarding breast cancer screening rather than thresholds based on absolute 5-year risk from current age. METHODS: We used the Prospective Family Cohort Study of 14 657 women without breast cancer at baseline in which, during a median follow-up of 10 years, 482 women were diagnosed with invasive breast cancer. We examined the performances of the International Breast Cancer Intervention Study (IBIS) and Breast and Ovarian Analysis of Disease Incidence and Carrier Estimation Algorithm (BOADICEA) risk models when using the alternative thresholds by comparing predictions based on 5-year risk with those based on lifetime risk from birth and remaining lifetime risk. All statistical tests were 2-sided. RESULTS: Using IBIS, the areas under the receiver-operating characteristic curves were 0.66 (95% confidence interval = 0.63 to 0.68) and 0.56 (95% confidence interval = 0.54 to 0.59) for 5-year and lifetime risks, respectively (Pdiff < .001). For equivalent sensitivities, the 5-year incidence almost always had higher specificities than lifetime risk from birth. For women aged 20-39 years, 5-year risk performed better than lifetime risk from birth. For women aged 40 years or older, receiver-operating characteristic curves were similar for 5-year and lifetime IBIS risk from birth. Classifications based on remaining lifetime risk were inferior to 5-year risk estimates. Results were similar using BOADICEA. CONCLUSIONS: Our analysis shows that risk stratification using clinical models will likely be more accurate when based on predicted 5-year risk compared with risks based on predicted lifetime and remaining lifetime, particularly for women aged 20-39 years.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,027
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,140

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0270,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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