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Enregistrement W3112809978 · doi:10.21203/rs.3.rs-650961/v1

A Multi-omics Study of Circulating Phospholipid Markers of Blood Pressure

2021· preprint· en· W3112809978 sur OpenAlexaff
Jun Liu, Paul S. de Vries, Fabiola Del Greco M, Åsa Johansson, Katharina E. Schraut, Caroline Hayward, Ko Willems van Dijk, Oscar H. Franco, Andrew A. Hicks, Véronique Vitart, Igor Rudan, Harry Campbell, Ozren Polašek, Peter P. Pramstaller, James F. Wilson, Ulf Gyllensten, Cornelia M. van Duijn, Abbas Dehghan, Ayşe Demirkan

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensCentre for Global Health Research
Organismes subventionnairesUppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational ScienceUniversitätsklinikum RegensburgWellcome TrustMedical Research CouncilSveučilište u Zagrebu
Mots-clésBlood pressureInternal medicineMendelian randomizationInsulin resistanceBody mass indexDiabetes mellitusMedicineEndocrinologyObesityBiologyGeneticsGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background High-throughput techniques allow us to measure a wide-range of phospholipids which can provide insight into the mechanisms of hypertension. We aimed to conduct an in depth multi-omics study of various phospholipids with systolic blood pressure (SBP) and diastolic blood pressure (DBP).Methods The associations of blood pressure and 151 plasma phospholipids measured by electrospray ionization tandem mass spectrometry were performed by linear regression in five European cohorts (n = 2,786 in discovery and n = 1,185 in replication). We further explored the blood pressure-related phospholipids in Erasmus Rucphen Family (ERF) study by associating them with multiple cardiometabolic traits (linear regression) and predicting incident hypertension (Cox regression). Mendelian Randomization (MR) and phenome-wide association study (pheWAS) were also explored to further investigate these association results.Results We identified six phosphatidylethanolamines (PE 38:3, PE 38:4, PE 38:6, PE 40:4, PE 40:5 and PE 40:6) and two phosphatidylcholines (PC 32:1 and PC 40:5) which together predicted incident hypertension with an area under the curve (AUC) of 0.61. The identified eight phospholipids are strongly associated with triglycerides, obesity related traits (e.g. waist, waist hip ratio, total fat percentage, body mass index, lipid-lowering medication, and leptin), diabetes related traits (e.g. glucose, insulin resistance and insulin) and prevalent type 2 diabetes. The genetic determinants of these phospholipids also associated with many lipoproteins, heart rate, pulse rate and blood cell counts. No significant association was identified by bi-directional MR approach.Conclusion We identified eight blood pressure-related circulating phospholipids that have a predictive value for incident hypertension. Our cross-omics analyses show that phospholipid metabolites in the circulation may yield insight into blood pressure regulation and raise a number of testable hypothesis for future research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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