MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3113204569 · doi:10.1093/neuonc/noaa215.003

BIOM-03. INVASIVE HISTOPATHOLOGY DRIVES POOR OUTCOMES IN SURGICALLY RESECTED BRAIN METASTASES

2020· article· en· W3113204569 sur OpenAlexaff
Matthew Dankner, Maxime Caron, Tariq Al‐Saadi, Wenqing Yu, Véronique Ouellet, Rima Ezzeddine, Matthew G. Annis, Phuong Uyen Le, Javad Nadaf, Noah S Neubarth, Paul Savage, Dongmei Zuo, Charles Couturier, Jean Monlong, Haig Djambazian, Huda Altoukhi, Guillaume Bourque, Jiannis Ragoussis, Roberto J. Diaz, Morag Park, Marie‐Christine Guiot, Stéphanie Lam, Kevin Petrecca, Peter M. Siegel

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBrain Metastases and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBrain metastasisMetastasisImmunohistochemistryHistopathologyCancerCellCancer researchPathologyOncologyInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract BACKGROUND Surgery as a single modality for the treatment of brain metastases (BrM) results in local recurrence (LR) in 60% of patients. These failure rates are reduced by half with post-operative radiotherapy. The non-invasive nature of BrM has led to the assumption that local recurrence is caused by spillage of cancer cells into the surgical cavity at the time of surgery. We present evidence suggesting that invasion of metastatic cancer cells into the adjacent brain is present in the majority of BrM and is associated with LR, leptomeningeal metastasis (LM), and overall survival (OS). METHODS We assessed the histopathological growth pattern (HGP) of 164 surgically resected BrM. HGP was correlated with LR, LM and OS. Single-cell transcriptomics (scRNAseq) was performed on 15,615 cells from metastasis center (MC) and surrounding brain (SB) adjacent to the tumor. N=30 orthotopic patient-derived xenograft models (OPDX) were established from BrM. RESULTS 56/164 (34%) BrM specimens showed a minimally invasive (MI) HGP between the tumor and adjacent brain while 108/164 (66%) showed significant invasion of tumor lobules or single-cells into the brain (HI-HGP). HI-HGP was associated with LR, LM and shortened OS in BrM patients. scRNAseq identified abundant cancer cells in SB that overexpressed pathways and genes involved in cell survival and stress adaptation compared to matched cancer cells in MC. Validation of these targets with immunohistochemistry in patient and OPDX tissues revealed cold-inducible RNA binding protein (CIRBP) overexpression in HI-HGP patient and OPDX BrM. Modulation of CIRBP expression in OPDX and cell line models of HI-HGP BrM delayed BrM progression and extended OS. CONCLUSION HI-HGP is a poor prognostic indicator in patients with surgically resected BrM, establishing HGP as an important prognostic factor that should be considered by clinicians treating BrM patients. We identify CIRBP as a functional mediator of this process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeuro-OncologyMême sujetBrain Metastases and TreatmentTravaux en français237 207