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Enregistrement W3113209606 · doi:10.1111/zsc.12439

Assessing phylogeographic variation in the Rosyside Dace (Teleostei, Leuciscidae), a widespread morphologically variable taxon

2020· article· en· W3113209606 sur OpenAlexaboutno aff
Courtney A. Weyand, Kyle R. Piller

Notice bibliographique

RevueZoologica Scripta · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish Ecology and Management Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySubspeciesMonophylyTaxonZoologyPhylogeographyCladeCytochrome bPhylogenetic treeEvolutionary biologyRange (aeronautics)Lineage (genetic)GenusEcologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Clinostomus (Leuciscidae) is a wide‐ranging freshwater fish genus that occurs throughout eastern North America and southern portions of Canada with two species currently recognized: C. elongatus and C. funduloides. A previous taxonomic study of C. funduloides recognized two subspecies (estor and funduloides) and one diagnosed, but undescribed subspecies based on morphological characteristics and geographic distribution. In this study, we used three molecular markers (cytochrome b, S7 intron 1 and growth hormone intron 4) to test the three lineage hypothesis and evaluate genetic variation of C. funduloides across the range using Bayesian inference. Our results indicate that C. funduloides is not monophyletic, as individuals of C. elongatus nest within C. funduloides in both the mtDNA and nDNA phylogenetic analyses, although the position of C. elongatus varies between data sets. In addition, some of the recovered clades are deeply divergent from one another, further supporting the distinctiveness of many of the populations. Overall, these results suggest that subspecies designations are not warranted and a taxonomic revision is needed as Clinostomus is likely more diverse than is currently recognized.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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