MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3113353128 · doi:10.1101/2020.12.14.422783

Lactate Accelerates Mouse ES Cell Differentiation Towards the XEN Lineage

2020· preprint· en· W3113353128 sur OpenAlexafffund
Mohamed I. Gatie, Tyler T. Cooper, Gilles Lajoie, Gregory M. Kelly

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensChildren’s Health Research InstituteLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenDeutsches KrebsforschungszentrumNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésCell biologyEmbryonic stem cellBiologyGlycolysisExtracellularReprogrammingIntracellularCellular differentiationTranscriptomeCellBiochemistryMetabolismGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Metabolism plays a crucial role for cell survival and function; however, recent evidence has implicated it in regulating embryonic development. The inner cell mass undergoes orchestrated cellular divisions resulting in the formation of embryonic stem cells and extraembryonic endoderm (XEN) cells. Concomitantly, changes in the metabolic profile occurs during development and are well-documented in the embryonic lineages. However, a comprehensive multi-omics analysis of these features in XEN cells remains lacking. We observed that feeder-free XEN cells exhibited high sensitivity to glycolytic inhibition in addition to maintaining elevated intra- and extracellular lactate levels. XEN cells maintain high lactate levels by increased LDHA activity and re-routing pyruvate away from the mitochondria. Importantly, exogenous lactate supplementation or promoting intracellular lactate accumulation enhances XEN differentiation in vitro . Our results highlight how lactate contributes to XEN differentiation in the mammalian embryo and may serve to enhance reprogramming efficiency of cells used for regenerative medicine. Highlights Feeder-free XEN cells exhibit high sensitivity to glycolytic inhibition Distinct transcriptomic, proteomic and metabolomic profile exists between feeder-free ES and XEN cells Elevated intracellular and extracellular lactate is observed in feeder-free XEN cells Lactate enhances feeder-free XEN differentiation in vitro

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetPluripotent Stem Cells ResearchTravaux en français237 207