Apa I, Taq I and Fok I VDR polymorphisms: Functional effect on mRNA levels of amyloid beta transporters <i>LRP1</i> and <i>P‐gp</i> in lymphocytes of mild cognitive impairment patients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background LRP1 and P‐gp are the major efflux transporters of β‐amyloid peptide (Aβ) across the blood brain barrier and the expression of both transporters is mediated by the vitamin D receptor (VDR). Three single nucleotide VDR polymorphisms (SNPs) Taq I, Apa I and Fok I have been related to mild cognitive impairment (MCI); however, their functional effect on the expression of VDR and its target genes remains unclear. Method 76 MCI patients and 133 elderly volunteers were cognitively screened with the Montreal Cognitive assessment (MoCA) and MoCA‐MIS after signing an informed consent approved by the Ethics Committee of Hospital Clínico Unversidad de Chile. The VDR SNPs Apa (rs7975232), Taq (rs731236) and Fok I (rs2228570) were determined by TaqMan SNP genotyping assay. mRNA levels of VDR, LRP1 and P‐gp were evaluated by qPCR. Result The C and T alleles of Apa I and Taq I respectively were more frequent in the MCI (p < 0.05); additionally the odds ratio analysis (OR) was significant for both alleles (C allele OR: 1.5 p = 0.049; T allele OR: 1.89, p = 0.0044). There were no significant differences for Fok I polymorphism between the groups. Furthermore, the homozygous CC of Apa I had significantly lower mRNA levels of P‐gp and VDR than the homozygous AA and heterozygous AC (p < 0.05). The carriers of one copy of the C allele (TC) of Fok I had lower mRNA levels of VDR and of both transporters than the homozygous TT (p < 0.005). Conclusion The C and T alleles of Apa I and Taq I respectively might be risk alleles for MCI, as reported in other populations. In addition, we found that SNPs of the VDR gene are related to the decrease of the mRNA levels of the Aβ transporter P‐gp and the transcription factor VDR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».