Tissue-selective alternate promoters guide NLRP6 expression
Notice bibliographique
Résumé
The pryin domain (PYD) domain is involved in protein interactions that lead to assembly of immune-sensing complexes such as inflammasomes. The repertoire of PYD-containing genes expressed by a cell type arms tissues with responses against a range of stimuli. The transcriptional regulation of the PYD gene family however is incompletely understood. Alternative promoter utilization was identified as a mechanism regulating the tissue distribution of human PYD gene family members, including NLRP6 that is translationally silenced outside of intestinal tissue. Results show that alternative transcriptional promoters mediate NLRP6 silencing in mice and humans, despite no upstream genomic synteny. Human NLRP6 contains an internal alternative promoter within exon 2 of the PYD, resulting in a truncated mRNA in nonintestinal tissue. In mice, a proximal promoter was used that expanded the 5' leader sequence restricting nuclear export and abolishing translational efficiency. Nlrp6 was dispensable in disease models targeting the kidney, which expresses noncanonical isoforms. Thus, alternative promoter use is a critical mechanism not just for isoform modulation but for determining expression profile and function of PYD family members.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».