MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3113731850

Membrane damage-responsive biosensors for the discovery of antimicrobials from Lenzites betulina and Haploporus odorus

2017· article· en· W3113731850 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueURSCA Proceedings · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensAthabasca UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntimicrobialPseudomonas aeruginosaAntibioticsBacterial outer membraneMicrobiologyBiologyAntimicrobial peptidesBiosensorChemistryEscherichia coliBacteriaBiochemistryGeneGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antibiotic resistance of pathogens to antibiotics is a growing concern in medical treatment of infections. Conventional methods for antimicrobial screening relies on using disc diffusion to observe zones of inhibition. However, this method is not sensitive enough to possibly detect sub-lethal activities. We have developed biosensors in Pseudomonas aeruginosa that produce light from transcriptional lux fusions in response to compounds that damage the outer membrane. Sub-lethal exposure to antimicrobial peptides, the antibiotic cycloserine, and cation chelators induces the expression of arnC::lux (PA3553) and speE2::lux (PA4774). These genes encode outer surface modifications that ultimately protect the P. aeruginosa outer membrane from exposure to sub-lethal concentrations of membrane-active compounds. We used high throughput screening in 96 well micro plate format to test the culture supernatants from a panel of fungal species isolated in Alberta. Preliminary results showed a significant induction of both strains of lux biosensors in 23 of the 29 fungal species screened. Due to the significant amount of biosensor induction induced by the supernatants from Lenzites betulina and Haploporus odorus, efforts have been directed to the purification, isolation and classification of the active component of the supernatant. Whole genome sequencing has become necessary in order to properly analyze the mass spectrometry results that have already been obtained. In a short period of time, it has been possible to quickly and more accurately detect sub-lethal concentrations of antimicrobial compounds that might have been over looked if tradition methods, such as disc diffusion, had been employed. * Indicates faculty mentor

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,522

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle