COVID-19 Renal Pathology Protocols and Pathology Practice in Latin America: Analysis from GlomCon Latin America Working Group (LGlomCon)
Notice bibliographique
Résumé
Background: A significant fraction of patients with COVID-19 display renal involvement (60%); however, the histological findings and pathology practice in Latin America (LA) have not been reported. The aim is to know how COVID-19 pandemic has affected the protocols for renal pathology and the main pathology findings in the kidney. Methods: An online survey with 75 questions in 6 sections, directed to pathologists, nephrologists and other specialists from 16 Spanish speaking LA countries treating COVID patients with kidney involvement. We are analyzing the impact of COVID-19 in renal pathology and pathology practice in LA. Results: From 430 responses, 360 (84%) were considered for analysis. Only13 participants from 16 countries were renal pathologists but the rest of responders also contributed with the pathology section. Only 10% is performing renal biopsies (RBx) of COVID-19 patients. Acute kidney injury (AKI) (85%) was the most frequent indication for RBx, hematuria-proteinuria (42%), nephrotic syndrome (28%) and subnephrotic proteinuria (21%). Combination of AKI and other syndrome was seen. Handling fresh tissue for immunofluorescence (IF) is a regular practice in the centers that perform IF (66%). No ultrastructural examination in 90% due to the lack of EM equipment. Postmortem studies only in 3% of the centers. Autopsy and biopsies shiwed thrombotic microangiopathy (TMA), with acute tubular injury (ATI). Pathology redeployment to clinical areas, ICU and inpatient care is seen in 12%. Only 70% of those received guidance or updating clinical courses. Conclusions: The survey has highlighted the deep shortage of renal pathologists and the lack of equipment (EM) compromising the best practice of renal pathology in LA. Protocols for tissue handling for COVID have not been established in any center, adding a burden to the practice. Most frequent indication for renal biopsy is AKI while the presence of TMA and ATI is found in autopsy and renal samples. Collapsing glomerulopathy (CG) has a high prevalence in hispanics and has been described in COVID patients, however CG was not seen. Outbreaks had forzed pathology redeployment to clinical care without proper preparation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».