Modeling by disruption and a selected-for partner for the nude locus
Notice bibliographique
Résumé
A long-standing problem in biology is how to dissect traits for which no tractable model exists. Here, we screen for genes like the nude locus (Foxn1)-genes central to mammalian hair and thymus development-using animals that never evolved hair, thymi, or Foxn1. Fruit flies are morphologically disrupted by the FOXN1 transcription factor and rescued by weak reductions in fly gene function, revealing molecules that potently synergize with FOXN1 to effect dramatic, chaotic change. Strong synergy/effectivity in flies is expected to reflect strong selection/functionality (purpose) in mammals; the more disruptive a molecular interaction is in alien contexts (flies), the more beneficial it will be in its natural, formative contexts (mammals). The approach identifies Aff4 as the first nude-like locus, as murine AFF4 and FOXN1 cooperatively induce similar cutaneous/thymic phenotypes, similar gene expression programs, and the same step of transcription, pre-initiation complex formation. These AFF4 functions are unexpected, as AFF4 also serves as a scaffold in common transcriptional-elongation complexes. Most likely, the approach works because an interaction's power to disrupt is the inevitable consequence of its selected-for power to benefit.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».