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Enregistrement W3114849019 · doi:10.1101/2020.12.25.424408

Interactions between discrete events and continuous dynamics in the regulation of scallops valve opening: insights from a biophysical model

2020· preprint· en· W3114849019 sur OpenAlexaff
Jean‐Marc Guarini, Jennifer Coston‐Guarini, Luc A. Comeau

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésScallopAdductor musclesDynamics (music)MechanicsAnatomyBiologyEcologyPhysicsAcoustics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This study constitutes a first attempt to quantify processes that govern valve gape dynamics in bivalves. We elected to focus on the scallop, Pecten maximus , not only because of its economic importance but also because it has a complex behaviour and high sensitivity to stress, which can be inferred from valve gape dynamics. The adductor muscle is the primary organ implicated in valve movements. Scallops, as other bivalves, move their valves sharply to ensure basic physiological functions or to respond to stressing conditions; these sharp events can be perceived as discrete events within a continuous dynamic. A biophysical model, originally designed for human muscles, was first selected to simulate the adductor muscle contraction, countering the passive valve opening by the umbo ligament. However, to maintain the possibility of rapid valve movements, described as typical of bivalves behaviour, it was necessary to modify the model and propose an original formulation. The resulting hybrid modelling simulates how valve opening tends to converge continuously toward a stable steady-state angle, while being interspersed with discrete, sharp closing events, deviating values from this equilibrium. The parameters of the new model were estimated by optimization using Hall-Effect Sensor valvometry data recorded in controlled conditions. Equilibrium of the continuous regime (when fiber activation equals deactivation) was estimated for a gape angle close to ca . 15 degrees, which is ca . 45% of the maximum opening angle, hence implying a constant effort produced by the adductor muscle. The distribution of time intervals between two successive discrete events did not differ significantly from a random process, but the peak amplitudes deviated from randomness, suggesting they are regulated physiologically. These results suggest that discrete events interact with continuous dynamic regimes, regulating valve opening to minimize physiological efforts and conserve energy. However, because the overall physiological state of the scallop organism conditions the activity of the adductor muscle, a complete understanding of the physiology of bivalves will require linking a more comprehensive model of valve gape dynamics with experimental observations of physiological energy consumption under different conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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