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Enregistrement W3114939515 · doi:10.21203/rs.3.rs-107891/v2

The first 100 days of the COVID-19 epidemic in Mali: a descriptive analysis

2020· preprint· en· W3114939515 sur OpenAlexaff
Birama Apho Ly, Mohamed Ali Ag Ahmed, Tamba Mina Millimouno, Yacouba Cissoko, Christophe Laba Faye, Fatoumata Traoré, Niélé Hawa Diarra, Ibrahima Berthé, Ahmadou Boly, Hamadoun Sangho, Seydou Doumbia

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesSocialdepartementet
Mots-clésChristian ministryCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Contact tracingMedicineDemographyStatistical significanceDescriptive statisticsTest (biology)Statistical softwareGeographyEnvironmental healthStatisticsInternal medicineBiologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Since the detection of the first cases of COVID-19 in Mali, the ministry of health provides daily released of information and situation report including information on the number of testing, confirmed cases, case-contacts, recovered patients, COVID-19 related deaths; and the geographic locations affected by the epidemic. The objective of this study was to analyze this information and to examine the relation between the number of confirmed cases and the number of testing, case-contacts, recovered patients and COVID-19 related deaths. Method From the daily released of information and situation reports, the data related to the number of testing, confirmed cases, case-contacts, recovered patients, COVID-19 related deaths; and the affected geographic locations were extracted on an Excel file before being analyzed with SPSS 25 software. The analyses were essentially descriptive including Spearman correlation test and Chi 2 test for statistical significance (p≤0, 05).Results The analyses include 14,938 testing, 2,260 PCR confirmed cases, 12, 864 case-contacts, 1,502 recovered patients and 117 deaths reported during the first 100 days of the epidemic, particularly from March 25 to July 2, 2020. The results show low level of testing and demonstrate a positive correlation between the number of confirmed cases and the number of testing, case-contacts, recovered patients and deaths. These results suggest that Mali could have more confirmed cases by increasing testing, particularly among case-contacts.Conclusion The results can help to understand the evolution of the epidemic, call for more testing and contact tracing of COVID-19 cases. They can also contribute to improving data quality and response to COVID-19.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,604
Tête enseignante GPT0,548
Écart entre enseignants0,056 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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