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Trans-ancestry genome-wide association meta-analysis of prostate cancer identifies new susceptibility loci and informs genetic risk prediction
David V. Conti, Burcu F. Darst, Lilit C. Moss, Edward J. Saunders, Xin Sheng, Alisha Chou, Fredrick R. Schumacher, Ali Amin Al Olama, Sara Benlloch, Tokhir Dadaev, Mark N. Brook, Ali Sahimi, Thomas J. Hoffmann, Atushi Takahashi, Koichi Matsuda, Yukihide Momozawa, Masashi Fujita, Kenneth Muir, Artitaya Lophatananon, Peggy Wan, Loı̈c Le Marchand, Lynne R. Wilkens, Victoria L. Stevens, Susan M. Gapstur, Brian D. Carter, Johanna Schleutker, Teuvo L.J. Tammela, Csilla Sipeky, Anssi Auvinen, Graham G. Giles, Melissa C. Southey, Robert J. MacInnis, Cezary Cybulski, Dominika Wokołorczyk, Jan Lubiński, David E. Neal, Jenny L. Donovan, Freddie C. Hamdy, Richard M. Martin, Børge G. Nordestgaard, Sune F. Nielsen, Maren Weischer, Stig E. Bojesen, Martin Andreas Røder, Peter Iversen, Jyotsna Batra, Suzanne K. Chambers, Leire Moya, Lisa G. Horvath, Judith A. Clements, Wayne D. Tilley, Gail P. Risbridger, Henrik Grönberg, Markus Aly, Robert Szulkin, Martin Eklund, Tobias Nordström, Nora Pashayan, Alison M. Dunning, Maya Ghoussaini, Ruth C. Travis, Timothy J. Key, Elio Ríboli, Jong Y. Park, Thomas A. Sellers, Hui‐Yi Lin, Demetrius Albanes, Stephanie J. Weinstein, Lorelei A. Mucci, Edward L. Giovannucci, Sara Lindström, Peter Kraft, David J. Hunter, Kathryn L. Penney, Constance Turman, Catherine M. Tangen, Phyllis J. Goodman, Ian M. Thompson, Robert J. Hamilton, Neil E. Fleshner, Antonio Finelli, Marie‐Elise Parent, Janet L. Stanford, Elaine A. Ostrander, Milan S. Geybels, Stella Koutros, Laura E. Beane Freeman, Meir J. Stampfer, Alicja Wolk, Niclas Håkansson, Gerald L. Andriole, Robert N. Hoover, Mitchell J. Machiela, Karina D. Sørensen, Michael Borre, William J. Blot, Wei Zheng, Edward D. Yeboah, James E. Mensah, Yong‐Jie Lu, Hong-Wei Zhang, Ninghan Feng, Xueying Mao, Yudong Wu, Shan‐Chao Zhao, Zan Sun, Stephen N. Thibodeau, Shannon K. McDonnell, Daniel J. Schaid, Catharine West, N.G. Burnet, Gill Barnett, Christiane Maier, Thomas Schnoeller, Manuel Luedeke, Adam S. Kibel, Bettina F. Drake, Olivier Cussenot, Géraldine Cancel‐Tassin, F. Ménégaux, Thérèse Truong, Yves Akoli Koudou, Esther M. John, Eli Marie Grindedal, Lovise Mæhle, Kay‐Tee Khaw, Sue A. Ingles, Mariana C. Stern, Ana Vega, Antonio Gómez‐Caamaño, Laura Fachal, Barry S. Rosenstein, Sarah L. Kerns, Harry Ostrer, Manuel R. Teixeira, Paula Paulo, Andreia Brandão, Stephen Watya, Alexander Lubwama, Jeannette T. Bensen, Elizabeth T. H. Fontham, James L. Mohler, Jack A. Taylor, Manolis Kogevinas, Javier Llorca, Gemma Castaño‐Vinyals, Lisa Cannon‐Albright, Craig C. Teerlink, Chad D. Huff, Sara S. Strom, Luc Multigner, Pascal Blanchet, Laurent Brureau, Radka Kaneva, Chavdar Slavov, Vanio Mitev, Robin J. Leach, Brandi Weaver, Hermann Brenner, Katarina Ćuk, Bernd Holleczek, Kai-Uwe Saum, Eric A. Klein, Ann W. Hsing, Rick A. Kittles, Adam B. Murphy, Christopher J. Logothetis, Jeri Kim, Susan L. Neuhausen, Linda Steele, Yuan Chun Ding, William B. Isaacs, Barbara Nemesure, Anselm Hennis, John Carpten, Hardev Pandha, Agnieszka Michael, Kim De Ruyck, Gert De Meerleer, Piet Ost, Jianfeng Xu, Azad Hassan Abdul Razack, Jasmine Lim, Soo‐Hwang Teo, Lisa F. Newcomb, Daniel Lin, Jay H. Fowke, Christine Neslund‐Dudas, Benjamin A. Rybicki, Marija Gamulin, Davor Lessel, Tomislav Kuliš, Nawaid Usmani, Sandeep K. Singhal, Matthew Parliament, Frank Claessens, Steven Joniau, Thomas Van den Broeck, Manuela Gago-Domínguez, Jose E. Castelao, Marı́a Elena Martı́nez, Samantha Larkin, Paul A. Townsend, Claire Aukim-Hastie, William S. Bush, Melinda C. Aldrich, Dana C. Crawford, Shiv Srivastava, Jennifer Cullen, György Petrovics, Graham Casey, Monique J. Roobol, Guido Jenster, Ron H. N. van Schaik, Jennifer J. Hu, Maureen Sanderson, Rohit Varma, Roberta McKean‐Cowdin, Mina Torres, Nicholas Mancuso, Sonja I. Berndt, Stephen K. Van Den Eeden, Douglas F. Easton, Stephen J. Chanock, Michael B. Cook, Fredrik Wiklund, Hidewaki Nakagawa, Rosalind A. Eeles, Zsofia Kote‐Jarai, Christopher A. Haiman
Notice bibliographique
RevueNature Genetics · 2021
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversité de MontréalPrincess Margaret Cancer CentreInstitut National de la Recherche ScientifiqueUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilEuropean Society for Medical OncologyNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesCancer Research UKWellcome TrustNational Institute of Environmental Health SciencesIpsenNational Institute for Health and Care ResearchAchievement Rewards for College Scientists Foundation
Mots-clésProstate cancerOdds ratioBiologyGenome-wide association studyGenetic genealogyPopulationConfidence intervalDemographyGeneticsCancerOncologyInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismMedicineGenotypeGene
Résumé
OpenAlex consigne un résumé pour ce travail, mais il n'a pas pu être récupéré à l'instant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,638
Score d'incertitude au seuil1,000
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations500
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui