MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3115420319 · doi:10.1101/2020.12.24.20248786

Acceptable Performance of the Abbott ID NOW Among Symptomatic Individuals with Confirmed COVID-19

2020· preprint· en· W3115420319 sur OpenAlexafffund
William Stokes, Byron M. Berenger, Takshveer Singh, Ifueko Adeghe, Angela Schneider, Danielle Portnoy, Teagan King, Brittney Scott, Kanti Pabbaraju, Sandy Shokoples, Anita Wong, Kara Gill, LeeAnn Turnbull, Jia Hu, Graham Tipples

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensAlberta Health ServicesUniversity of CalgaryUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaAlberta Precision LaboratoriesAlberta Health Services
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Confidence intervalThroatPandemicFood and drug administration2019-20 coronavirus outbreakPediatricsInternal medicineVirologySurgeryMedical emergencyDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION Point of care diagnostic tests for SARS-CoV-2, such as the ID NOW, have great potential to help combat the COVID-19 pandemic. The ID NOW is approved by the United States Food and Drug Administration (FDA) for the detection of SARS-CoV-2 in symptomatic individuals within the first 7 days of symptom onset for COVID-19 if tested within 1 hour of specimen collection. However, clinical data on the performance of the ID NOW is limited, with many studies deviating from the manufacturer’s instructions and/or having small sample size. METHODS Adults with COVID-19 in the community or hospital were recruited into the study. Paired throat swabs were collected, with one throat swab transported immediately in an empty sterile tube to the laboratory for ID NOW testing, and the other transported in universal transport media and tested by an in-house SARS-CoV-2 RT-PCR assay targeting the E-gene. Positive percent agreement (PPA) was calculated. RESULTS 133 individuals were included in the study. 129 samples were positive on either the ID NOW and/or RT-PCR. Assuming any positive result on either assay represents a true positive, PPA of the ID NOW compared to RT-PCR with 95% confidence intervals was 89.1% [82.0% - 94.1%] and 91.6% [85.1% - 95.9%], respectively. When analyzing individuals with symptoms ≤ 7 days and who had the ID NOW performed within an hour, ID NOW PPA increased to 98.2%. DISCUSSION In this study, SARS-CoV-2 results from the ID NOW were reliable, especially when testing was adhered to manufacturer’s recommendations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,280
Score d'incertitude au seuil0,909

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxivMême sujetSARS-CoV-2 detection and testingTravaux en français237 207