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Enregistrement W3115718122 · doi:10.1101/2020.12.24.20248799

Blinded study: prospectively defined high frequency oscillations predict seizure outcome in individual patients

2020· preprint· en· W3115718122 sur OpenAlexaboutno aff
Vasileios Dimakopoulos, Pierre Mégevand, Ece Boran, Shahan Momjian, Margitta Seeck, Serge Vulliémoz, Johannes Sarnthein

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEpilepsy research and treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversität ZürichUniversité de GenèveSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésIctalEpilepsyEpilepsy surgeryProspective cohort studyMedicineAudiologyNuclear medicineAnesthesiaSurgeryPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Interictal high frequency oscillations (HFO) are discussed as biomarkers for epileptogenic brain tissue that should be resected in epilepsy surgery to achieve seizure freedom. The prospective classification of tissue sampled by individual electrode contacts remains a challenge. We have developed an automated, prospective definition of clinically relevant HFO in intracranial EEG (iEEG) from MNI Montreal and tested it in iEEG from Zurich. We here validate the algorithm on iEEG recorded in an independent epilepsy center so that HFO analysis was blinded to seizure outcome. Methods We selected consecutive patients from Geneva University Hospitals who underwent resective epilepsy surgery with postsurgical follow-up > 12 months. We analyzed long-term iEEG recordings during non-rapid eye movement (NREM) sleep that we segmented into intervals of 5 min. HFOs were defined in the ripple (80-250 Hz) and the fast ripple (FR, 250-500 Hz) frequency band. Contacts with the highest rate of ripples co-occurring with FR (FRandR) designated the HFO area. If the HFO area was not fully resected and the patient suffered from recurrent seizures (ILAE 2-6), this was classified as a true positive (TP) prediction. Results We included iEEG recordings from 16 patients (median age 32 y, range [18-53]) with stereotactic depth electrodes and/or with subdural electrode grids (median follow-up 27 mo, range [12-55]). The HFO area had high test-retest reliability across intervals (median dwell time 95%). We excluded two patients with dwell time < 50% from further analysis. The HFO area was fully included in the resected volume in 2/4 patients who achieved postoperative seizure freedom (ILAE 1, specificity 50%) and was not fully included in 9/10 patients with recurrent seizures (ILAE > 1, sensitivity 90%), leading to an accuracy of 79%. Conclusions We validated the automated procedure to delineate the clinical relevant HFO area in individual patients of an independently recorded dataset and achieved the same good accuracy as in our previous studies. Significance The reproducibility of our results across datasets is promising for a multicienter study testing the clinical application of HFO detection to guide epilepsy surgery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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