MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3116039323 · doi:10.3201/eid2701.191650

Estimating the Force of Infection for Dengue Virus Using Repeated Serosurveys, Ouagadougou, Burkina Faso

2020· article· en· W3116039323 sur OpenAlexafffund
Jacqueline Kyungah Lim, Mabel Carabalí, Tansy Edwards, Ahmed Barro, Jung-Seok Lee, Désiré Lucien Dahourou, Kang Sung Lee, Teguewende Nikiema, Mee‐Young Shin, Thérèse Kagone, Losseni Kaba, Suk Namkung, Paul‐André Somé, Jae Seung Yang, Valéry Ridde, In‐Kyu Yoon, Neâl Alexander, Seydou Yaro

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesEuropean and Developing Countries Clinical Trials PartnershipCanadian Institutes of Health ResearchBill and Melinda Gates FoundationEuropean CommissionMedical Research CouncilDepartment for International Development
Mots-clésMedicineSeroconversionOutbreakDengue feverSerologyDemographyDengue virusAttack rateVirologyImmunologyVirusAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RESEARCH D engue fever is a mosquitoborne disease caused by 4 related but antigenically distinct dengue viruses (DENVs), serotypes 1-4.Annually, ≈50-100 million cases of dengue are reported worldwide, with 20,000 deaths (1).Aedes mosquitoes and dengue cases were documented in Africa as early as 1823, and cases have since been reported in 34 countries in Africa (2).In Burkina Faso, since the first outbreak in 1925, there have been multiple others (2), including in 2013, 2016, and 2017 (3-5).The 2016 outbreak included 1,061 dengue rapid-diagnostic test (RDT) positive cases and 15 deaths in the capital, Ouagadougou, with a reported case-fatality rate (CFR) of 1.2% (4,6).The 2017 outbreak included 5,773 RDT-positive cases and 18 deaths throughout the country, for a CFR of 0.2% (5).These repeated outbreaks suggest a considerable dengue burden in the country.Despite this burden, data on dengue seroprevalence and force of infection (FOI), the rate at which initial or heterotypic infections are acquired, are scarce in Burkina Faso and Africa (7).In terms of seroprevalence in Burkina Faso, 1 study found the dengue IgG seroprevalence among 683 pregnant women and blood donors to be 26.3% in rural and 36.5% in urban settings in 2003-2004 (8).To define DENV transmission in Burkina Faso, we conducted 4 serologic surveys in the same study participants in Ouagadougou during 2015-2017.The study targeted 3 objectives.First, we measured seroprevalence of DENV by IgG positivity at enrollment, serosurvey 1 (S1).Second, we estimated age-specific annual FOI, measured by seroconversion in the repeated follow-up surveys ( S2-S4).Last, because a dengue outbreak occurred in 2016, between the third and fourth serosurveys, we identified and compared demographic and clinical characteristics associated with DENV seroconversion in the outbreak and nonoutbreak periods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,155

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEmerging infectious diseasesMême sujetMosquito-borne diseases and controlTravaux en français237 207