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Enregistrement W3116527571 · doi:10.1002/path.5605

The dysregulation of metabolic pathways and induction of the pentose phosphate pathway in renal ischaemia–reperfusion injury

2020· article· en· W3116527571 sur OpenAlexaff
Angelique M. L. Scantlebery, Alessandra Tammaro, James D. Mills, Elena Rampanelli, Lotte Kors, Gwendoline J.D. Teske, Loes M. Butter, Gerhard Liebisch, Gerd Schmitz, Sandrine Florquin, Jaklien C. Leemans, Joris J. T. H. Roelofs

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBiomedical Research and Pathophysiology
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekZonMwFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésPentose phosphate pathwayIschemiaPhosphateGlycolysisChemistryBiochemistryMedicineMetabolismInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lipid accumulation is associated with various forms of acute renal injury; however, the causative factors and pathways underpinning this lipid accumulation have not been thoroughly investigated. In this study, we performed lipidomic profiling of renal tissue following ischaemia-reperfusion injury (IRI). We identified a significant accumulation of cholesterol and specific phospholipids and sphingolipids in kidneys 24 h after IRI. In light of these findings, we hypothesised that pathways involved in lipid metabolism may also be altered. Through the analysis of published microarray data, generated from sham and ischaemic kidneys, we identified nephron-specific metabolic pathways affected by IRI and validated these findings in ischaemic renal tissue. In silico analysis revealed the downregulation of several energy and lipid metabolism pathways, including mitochondrial fatty acid beta-oxidation (FAO), peroxisomal lipid metabolism, fatty acid (FA) metabolism, and glycolysis. The pentose phosphate pathway (PPP), which is fuelled by glycolysis, was the only metabolic pathway that was upregulated 24 h following IRI. In this study, we describe the effect of renal IRI on metabolic pathways and how this contributes to lipid accumulation. © 2020 The Authors. The Journal of Pathology published by John Wiley & Sons, Ltd. on behalf of The Pathological Society of Great Britain and Ireland.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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