<i>Plasmodiophora brassicae</i> chitin-binding effectors guard and mask spores during infection
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Plants have a sophisticated and multilayered immune system. However, plant pathogens, helped by effector proteins, have found several strategies to evade plant immunity. For instance, the clubroot pathogen, Plasmodiophora brassicae, is able to turn the roots of the susceptible hosts into nutrient-sink galls surpassing patterns-triggered immunity (PTI) and effector-triggered immunity (ETI). Chitin, the main component of P. brassicae spores cell walls and a well-known pathogens-associated molecular pattern (PAMP), can elicit PTI but is also the target of plant chitinases and chitin deacetylases. The fact that P. brassicae does not trigger PTI during the infection of the susceptible hosts motivated a genome-wide search of genes coding for secreted chitin-related proteins. We found that P. brassicae genome encodes a large repertoire of candidate-secreted effectors containing the chitin-binding domain carbohydrate-binding module family 18 (CBM18), along with chitinases and chitin deacetylases domains. The role of such proteins in the pathogenicity of the clubroot pathogen is unknown. Here, we characterized the function of two effectors, Pb ChiB2 and Pb ChiB4, which are transcriptionally activated during the spores transition to uninucleate primary plasmodium and during the spore formation. Through co-precipitation, we found that recombinant Pb ChiB2 and Pb ChiB4 bind to the spores and to chitin oligomers in vitro . We also showed that both proteins suppress chitin-triggered activation of the immune MPK3 and MPK6 in the host Brassica napus . These findings suggest a dual role for the P. brassicae CBM18 proteins as effectors for protecting zoospores and resting spores formation and for suppressing chitin-triggered immunity during the infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».