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Enregistrement W3116803888 · doi:10.1101/2020.12.19.20248132

Early IFNβ secretion determines variable downstream IL-12p70 responses upon TLR4 activation in health and disease

2020· preprint· en· W3116803888 sur OpenAlexaff
Céline Posseme, Alba Llibre, Bruno Charbit, Vincent Bondet, Vincent Rouilly, Violaine Saint‐André, Jérémy Boussier, Jacob Bergstedt, Nikaïa Smith, Maxime Rotival, Michael S. Kobor, Thomas J. Scriba, Estelle Mottez, Stanislas Pol, Étienne Patin, Matthew L. Albert, Lluís Quintana‐Murci, Darragh Duffy

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésImmune systemDiseaseEpigeneticsImmunologyTLR4SecretionClinical significanceBiologyMedicineComputational biologyGeneGeneticsInternal medicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary The IL-12 family of cytokines comprises the only heterodimeric cytokines mediating diverse functional effects. We previously observed a bi-modal IL-12p70 response to LPS in healthy donors of the Milieu Interieur cohort. Herein, we demonstrate that IFNβ expression serves as an upstream determinant of variable IL-12p70 production. Integrative modelling of proteomic, genetic, epigenomic and cellular data confirmed IFNβ as key for regulation of LPS induced IL12A and IL-12p70 variability. The clinical relevance was supported by reduced and variable IL-12p70 responses in individuals infected with the hepatitis C virus (HCV), and findings that IFN-based therapy for HCV is more likely to fail in those patients with dysregulated pre-treatment IL-12p70 responses. In sum, our systems immunology approach has defined a better understanding of IL-12p70 and IFNβ in healthy and infected persons, providing insights into how common genetic and epigenetic variation may impact immune responses to bacterial infection in health and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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