Incidence and detection of high microsatellite instability in colorectal cancer in a Chinese population: a meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background: The 4 most common types of DNA mutations in tumors are single-nucleotide variations, insertion-deletion, fusion, and copy number variations. This is followed by microsatellite instability (MSI), which is known to trigger the development of MSI-high (MSI-H) cancer and is responsible for 300,000 new cases of cancer per year in China. We aim to conduct a meta-analysis based on a comparison between the positive rates of the National Cancer Institute (NCI) panel (also known as 2B3D NCI panel) and mononucleotide panels for the diagnosis of MSI in the Chinese population. Methods: In the present meta-analysis, we searched the PubMed, Embase, Web of Science, CNKI, Wanfang, CQVIP, and CBM databases. MSI diagnosis studies by PCR and capillary electrophoresis were included to compare the incidence of MSI-H in colorectal cancer obtained from panels with different microsatellite markers. Egger’s bias test was used to assess risk of bias. Results: Seventeen articles were included, which used the Newcastle-Ottawa Scale (NOS) scale for quality evaluation. The NOS scores of the included documents were ≥7 points, and the quality of the documents met the requirements. The incidence of MSI-H detected by the 2B3D NCI panel was 13.5% [95% confidence interval (CI): 10.8–16.4, I2=52.321%, P=0.026, n=10 studies including 2,681 participants], the incidence of MSI-H detected by the mononucleotide panels was 10.6% (95% CI: 7.1–14.7, I2=81.147%, P=0.000, n=7 studies including 3,249 participants). This indicates that, in the Chinese population, the 2B3D NCI panel can detect 27.4% more MSI-H cancers than the mononucleotide panels, 54.7% more MSI-H cancers than the panel of 6 mononucleotides, and its sensitivity is comparable to that of Promega. Conclusions: The findings of the meta-analysis demonstrated that, using the 2B3D NCI panel for MSI detection can avoid the underestimation of the incidence MSI-H in colorectal cancer and can be considered the most suitable panel for MSI detection in the Chinese population. The inclusion of only published data might be a potential source of publication bias.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».