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Enregistrement W3117179713 · doi:10.1152/ajplung.00090.2020

A neutrophil subset defined by intracellular olfactomedin 4 is associated with mortality in sepsis

2020· article· en· W3117179713 sur OpenAlexaff
Kirsten N. Kangelaris, Regina A. Clemens, Xiaohui Fang, Alejandra Jáuregui, Tom Liu, Kathryn Vessel, Thomas Deiss, Pratik Sinha, Aleksandra Leligdowicz, Kathleen D. Liu, Hanjing Zhuo, Matthew N. Alder, Hector R. Wong, Carolyn S. Calfee, Clifford A. Lowell, Michael A. Matthay

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Lung Cellular and Molecular Physiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSepsis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésMedicineSepsisInternal medicineProspective cohort studyCohortImmunologyGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sepsis is a heterogeneous syndrome clinically and biologically, but biomarkers of distinct host response pathways for early prognostic information and testing targeted treatments are lacking. Olfactomedin 4 ( OLFM4), a matrix glycoprotein of neutrophil-specific granules, defines a distinct neutrophil subset that may be an independent risk factor for poor outcomes in sepsis. We hypothesized that increased percentage of OLFM4+ neutrophils on sepsis presentation would be associated with mortality. In a single-center, prospective cohort study, we enrolled adults admitted to an academic medical center from the emergency department (ED) with suspected sepsis [identified by 2 or greater systemic inflammatory response syndrome (SIRS) criteria and antibiotic receipt] from March 2016 through December 2017, followed by sepsis adjudication according to Sepsis-3. We collected 200 µL of whole blood within 24 h of admission and stained for the neutrophil surface marker CD66b followed by intracellular staining for OLFM4 quantitated by flow cytometry. The predictors for 60-day mortality were 1) percentage of OLFM4+ neutrophils and 2) OLFM4+ neutrophils at a cut point of ≥37.6% determined by the Youden Index. Of 120 enrolled patients with suspected sepsis, 97 had sepsis and 23 had nonsepsis SIRS. The mean percentage of OLFM4+ neutrophils was significantly increased in both sepsis and nonsepsis SIRS patients who died ( P ≤ 0.01). Among sepsis patients with elevated OLFM4+ (≥37.6%), 56% died, compared with 18% with OLFM4+ <37.6% ( P = 0.001). The association between OLFM4+ and mortality withstood adjustment for age, sex, absolute neutrophil count, comorbidities, and standard measures of severity of illness (SOFA score, APACHE III) ( P < 0.03). In summary, OLFM4+ neutrophil percentage is independently associated with 60-day mortality in sepsis and may represent a novel measure of the heterogeneity of host response to sepsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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