Soil bacterial communities associated with stony soils influence the tuber size of Tetrastigma hemsleyanum
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Plants grown in stony soils have better-developed root systems and higher crop yields than those grown in non-stony soils. The roles of various physical and chemical effects of stony soils on plant growth have been published, but the roles of soil microbiota and rhizosphere microbiota have not been investigated. Methods Tetrastigma hemsleyanum plants were cultivated for two years in stony soils and in the same soil from which rock-fragments had been removed. The microbiome and the tuber transcriptome were analyzed, using multiple bioinformatics methods. Results The soil microbiota of these two soils were markedly different, and the stony soils contained high abundances of bacterial taxa belonging to the Actinobacteria, Rokubacteria, Rhizobiales, Desulfarculaceae, and Chthoniobacteraceae. These discriminatory taxa in soils may promote the tuber growth of T. hemsleyanum, through releasing nutrients from rocks and colonizing the rhizosphere and tuber surface of T. hemsleyanum. In addition, stony soils induced a dramatic change in the tuber’s transcriptome, particularly with respect to the pathways of phytohormone biosynthesis, photosynthesis, and biotic stress resistance, expression levels of which showed strong correlations with the aforementioned bacterial taxa. Conclusions These results indicated that beneficial effects of stony soils on plant growth may be closely correlated with their specific microbiota, which can, in turn, influence multiple biological processes of host. This is the first study to reveal the role of stony soils-driven microbiota in tuber growth, and stony soils can represent a microbial repository for the screening of microbial isolates to increase plant yield.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».