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Enregistrement W3117333251

Discovering antimicrobial properties from Ganoderma applanatum & Lentinula edodes

2017· article· en· W3117333251 sur OpenAlex
Azka Qasim, Shauna Zenteno

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueURSCA Proceedings · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Biology and Applications
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntimicrobialLentinulaSpermidineMicrobiologyBacteriaMutantCell wallBiologyChemistryBotanyBiochemistryGeneEnzymeGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This project involves the exploration of antimicrobial effects for the fungi Ganoderma applanatum and Lentinula edodes against the Gram-negative bacteria, Pseudomonas aeruginosa. Under stress, the cell wall of this bacteria is stabilized by the polycationic amine spermidine. The synthesis of spermidine is regulated by the PA3553 and PA4774 genes, both of which are controlled by two distinct pathways. Previously prepared PA3553::lux and PA4774::lux mutant strains of P. aeruginosa, which were programmed to illuminate upon gene activation via cell wall damage, were used for this study. Gene expression (determined via luminescence) and growth (optical density) was recorded weekly on the Wallace Victor luminescence plate reader for eight weeks to determine the period of greatest cell wall damage by the fungi. Data suggested highest amount of damage at week four and week eight for G. applanatum and L. edodes, respectively. In comparison to the control, G. applanatum showed a 22 fold PA3553::lux induction and a five fold PA4774::lux induction at a 20%v/v concentration during week four. Similarly, on week eight of growth L. edodes induced the PA3553 pathway 116 times more than the control when it was added at a 20%v/v concentration. Additionally, the fungal supernatants were also treated with trypsin. Significant reduction in gene induction was observed for both species after the trypsin digestion, suggesting the role of peptides as potential antimicrobial agents in G. applanatum and L. edodes. Future experiments will involve supernatant fractionation via column chromatography, followed by more screenings with the mutants to specify the antimicrobial compounds. * Indicates faculty mentor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,438

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle