Genome-Wide Identification and Expression Profiling Analysis of WOX Family Protein-Encoded Genes in Triticeae Species
Notice bibliographique
Résumé
The WOX family is a group of plant-specific transcription factors which regulate plant growth and development, cell division and differentiation. From the available genome sequence databases of nine Triticeae species, 199 putative WOX genes were identified. Most of the identified WOX genes were distributed on the chromosomes of homeologous groups 1 to 5 and originated via the orthologous evolution approach. Parts of WOX genes in Triticum aestivum were confirmed by the specific PCR markers using a set of Triticum. durum-T. aestivum genome D substitution lines. All of these identified WOX proteins could be grouped into three clades, similar to those in rice and Arabidopsis. WOX family members were conserved among these Triticeae plants; all of them contained the HOX DNA-binding homeodomain, and WUS clade members contained the characteristic WUS-box motif, while only WUS and WOX9 contained the EAR motif. The RNA-seq and qPCR analysis revealed that the TaWOX genes had tissue-specific expression feature. From the expression patterns of TaWOX genes during immature embryo callus production, TaWOX9 is likely closely related with the regulation of regeneration process in T. aestivum. The findings in this study could provide a basis for evolution and functional investigation and practical application of the WOX family genes in Triticeae species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».