Mind the <scp>GAP</scp>: Purification and characterization of urea resistant <scp>GAPDH</scp> during extreme dehydration
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The African clawed frog (Xenopus laevis) withstands prolonged periods of extreme whole‐body dehydration that lead to impaired blood flow, global hypoxia, and ischemic stress. During dehydration, these frogs shift from oxidative metabolism to a reliance on anaerobic glycolysis. In this study, we purified the central glycolytic enzyme glyceraldehyde‐3‐phosphate dehydrogenase (GAPDH) to electrophoretic homogeneity and investigated structural, kinetic, subcellular localization, and post‐translational modification properties between control and 30% dehydrated X. laevis liver. GAPDH from dehydrated liver displayed a 25.4% reduction in maximal velocity and a 55.7% increase in its affinity for GAP, as compared to enzyme from hydrated frogs. Under dehydration mimicking conditions (150 mM urea and 1% PEG), GAP affinity was reduced with a Km value 53.8% higher than controls. Frog dehydration also induced a significant increase in serine phosphorylation, methylation, acetylation, beta‐N‐acetylglucosamination, and cysteine nitrosylation, post‐translational modifications (PTMs). These modifications were bioinformatically predicted and experimentally validated to govern protein stability, enzymatic activity, and nuclear translocation, which increased during dehydration. These dehydration‐responsive protein modifications, however, did not appear to affect enzymatic thermostability as GAPDH melting temperatures remained unchanged when tested with differential scanning fluorimetry. PTMs could promote extreme urea resistance in dehydrated GAPDH since the enzyme from dehydrated animals had a urea I50 of 7.3 M, while the I50 from the hydrated enzyme was 5.3 M. The physiological consequences of these dehydration‐induced molecular modifications of GAPDH likely suppress GADPH glycolytic functions during the reduced circulation and global hypoxia experienced in dehydrated X. laevis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».