Description of the bacterial microbiota of anal sacs in healthy dogs.
Notice bibliographique
Résumé
The aim of the present study was to characterize the bacterial microbiota of anal sacs in healthy dogs using NGS. Swabs were used to sample the rectum and secretions from each anal sac in 15 healthy dogs. DNA was extracted from swabs and the V4 hypervariable region of the 16S rRNA gene was amplified and sequenced with Illumina MiSeq. Overall, 14 different bacterial phyla were identified in the rectum and in both anal sacs, the 5 main ones being Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, Actinobacteria, and Fusobacteria. The rectum had higher microbial diversity and richness than the left and right anal sacs. Community membership and structure significantly differed between the rectum and both anal sacs, but not between the right and the left anal sacs. This study showed that the diversity and richness of the bacterial microbiota of the anal sacs in dogs is greater than what has been reported in previous studies with culture-based methods. In conclusion, the bacterial microbiota of the anal sacs in dogs varies between individuals and differs from the rectal bacterial microbiota.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».