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Enregistrement W3118594740 · doi:10.1094/phyto-04-20-0143-r

Identification and Characterization of <i>Sphaerulina vaccinii</i> sp. nov. as the Cause of Leaf Spot and Stem Canker in Lowbush Blueberry and Its Epidemiology

2021· article· en· W3118594740 sur OpenAlexaff
Shawkat Ali, P.D. Hildebrand, Willy E. Renderos, Pervaiz A. Abbasi

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPycnidiumCankerInternal transcribed spacerLeaf spotSeptoriaMycosphaerellaBotanyAscocarpPathogenRibosomal DNAAscosporeRibosomal RNAConidiumHorticulturePhylogenetic treeGeneTaxonomy (biology)GeneticsSpore

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Septoria leaf spot and stem canker is an important disease of lowbush blueberry, but the causal pathogen has not been accurately identified. Based on sequence analysis of the internal transcribed spacer, translation elongation factor 1 alpha, RNA polymerase II second largest subunit, 28S nuclear ribosomal DNA gene, and β-tubulin genes, the pathogen aligns closely with the genus Sphaerulina. The phylogenetic analyses based on these loci demonstrate that while the pathogen is closely related to the species Sphaerulina amelanchier, it is sufficiently distinct to warrant a new species designation. No ascomata of the teleomorph were found; however, ascospores recovered from leaves fit, morphologically, with the genus Mycosphaerella. The morphological data also support a new species designation. Based on the host that this pathogen infects, we propose the name as Sphaerulina vaccinii and the disease as Sphaerulina leaf spot and stem canker. Under field conditions, it appears that initial inoculum originates from pycnidia on overwintered leaves and stem lesions (cankers) on fruiting stems. More than 90% of the initial inoculum was released during the flowering period from late May through June. Leaf spots began to appear in early June and disease severity increased in a linear manner over time. Secondary inoculum production from diseased foliage was minimal and not considered important epidemiologically. Defoliation resulting from disease began in early July and increased in a nonlinear manner thereafter. Manual defoliation of blueberry stems at various times prior to harvest showed the substantial extent to which premature defoliation by this disease can affect yield. Stem lesions were also shown to have an impact on yield, even though stems were not killed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,610
Score d'incertitude au seuil0,339

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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