Ozone-Induced DNA Damage: A Pandora’s Box of Oxidatively Modified DNA Bases
Notice bibliographique
Résumé
Ozone is a major component of air pollution and carries potentially mutagenic and harmful affects to health. The oxidation of isolated calf thymus DNA (CT-DNA) led to the nearly quantitative loss of normal DNA 2′-deoxyribonucleosides in the following order: T > G > C ≫ A. The major modification of pyrimidines (T, C, and 5-methylcytosine (5mC)) was the corresponding 5-hydroxyhydantoin derivative after complete digestion of DNA to its component 2′-deoxyribonucleosides. The oxidation of 5mC was 2.5-fold more susceptible than C considering the relative mole fraction of 5mC to C in CT-DNA. Other common oxidation products of pyrimidines (e.g., 5,6-dihydroxy-5,6-dihydropyrimidines, the so-called pyrimidine 5,6-glycols) were formed with a lower yield than 5-hydroxyhydantoin derivatives. In addition, several common oxidation products of G were observed (e.g., 8-oxo-7,8-dihydroguanine (8oxoG)) albeit with relatively minor yields. The sum of individual products was notably less than the loss of 2′-deoxyribonucleosides from which they were derived. In a search for additional products, we discovered the formation of pyrimidine ring fragments, predominantly N -formamide and N -urea, which were measured as a dinucleotide next to a nonmodified nucleotide upon partial digestion of oxidized DNA. Interestingly, the latter fragments were also observed in dinucleotides containing 8oxoG, indicating the formation of tandem lesions during ozonolysis of DNA. The oxidation of DNA upon exposure to ozone can be explained by reactions of an intermediate ozonide. These studies underline the complexity of ozone-induced DNA damage and provide valuable information to assess the formation of this damage in cellular DNA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».