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Enregistrement W3118657839

The role of eukaryotic initiation factor 5B (eIF5B) in cell cycle regulation

2018· article· en· W3118657839 sur OpenAlexaff
Kamiko R. Bressler, Divya Sharma, Nehal Thakor

Notice bibliographique

RevueURSCA Proceedings · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEukaryotic initiation factorInternal ribosome entry siteUpstream open reading frameBiologyCell biologyEukaryotic translationeIF2Five prime untranslated regionTranslational regulationIntegrated stress responseInitiation factorCell cycleTranslation (biology)CellMessenger RNABiochemistryGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gene expression is critically regulated at the transcriptional, translational, and post-translational levels. Dysregulation and altered mechanisms of translational control have significant consequences in processes including cell growth, cell death, cell proliferation, and maturation. Initiation is the rate- limiting step of translation, which is inhibited under physiological stress conditions. During the integrated stress response, the α subunit of eukaryotic initiation factor 2 (eIF2) is phosphorylated. This phosphorylation attenuates general translation, by preventing the reformation of the necessary ternary complex. Despite the attenuation of general translation, certain mRNAs containing upstream open reading frames (uORFs) are favorably translated during this condition. uORFs are mRNA elements with a start codon in the 5’ UTR that is out-of-frame with the main coding sequence. Bioinformatic studies have shown 49% of human transcripts to contain uORFs. Preliminary data suggests that the depletion of eIF5B parallels the effects of phosphorylation of eIF2α. eIF5B depletion has been observed to inhibit global translation, while enhancing the translation of certain uORF-containing mRNAs. The Thakor lab has shown the protein p27 to be upregulated when eIF5B is knocked down in U343 (human glioblastoma multiforme) cells. As p27 is a cyclin-dependent kinase inhibitor (CKI), which controls cell progression from the G1 to S phase, this suggests a significant role for eIF5B in the cell cycle. However, eIF5B depletion has been observed to not have significant effects on the cyclin-dependent kinase inhibitor: p21. Further, PI staining and flow cytometric analysis have demonstrated that eIF5B does not have any significant effects on the cell cycle. This data suggests that eIF5B has a significant role in the regulation of p27, but does not contribute to cell cycle regulation. *Indicates presenter

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,273

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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