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Enregistrement W3118728404 · doi:10.1186/s13287-020-02109-4

Overcoming bioprocess bottlenecks in the large-scale expansion of high-quality hiPSC aggregates in vertical-wheel stirred suspension bioreactors

2021· article· en· W3118728404 sur OpenAlexafffund
Breanna S. Borys, Tiffany Dang, Tania So, Leili Rohani, Tamás Révay, Tylor Walsh, Madalynn Thompson, Bob Argiropoulos, Derrick E. Rancourt, Sunghoon Jung, Yas Hashimura, Brian Lee, Michael S. Kallos

Notice bibliographique

RevueStem Cell Research & Therapy · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalAlberta Health ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Children's Hospital Research InstituteStem Cell Network
Mots-clésBioprocessBioreactorScale (ratio)Suspension (topology)SCALE-UPSuspension cultureBiochemical engineeringProcess engineeringChemistryEngineeringBiologyChemical engineeringPhysicsMathematicsCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) hold enormous promise in accelerating breakthroughs in understanding human development, drug screening, disease modeling, and cell and gene therapies. Their potential, however, has been bottlenecked in a mostly laboratory setting due to bioprocess challenges in the scale-up of large quantities of high-quality cells for clinical and manufacturing purposes. While several studies have investigated the production of hiPSCs in bioreactors, the use of conventional horizontal-impeller, paddle, and rocking-wave mixing mechanisms have demonstrated unfavorable hydrodynamic environments for hiPSC growth and quality maintenance. This study focused on using computational fluid dynamics (CFD) modeling to aid in characterizing and optimizing the use of vertical-wheel bioreactors for hiPSC production. METHODS: The vertical-wheel bioreactor was modeled with CFD simulation software Fluent at agitation rates between 20 and 100 rpm. These models produced fluid flow patterns that mapped out a hydrodynamic environment to guide in the development of hiPSC inoculation and in-vessel aggregate dissociation protocols. The effect of single-cell inoculation on aggregate formation and growth was tested at select CFD-modeled agitation rates and feeding regimes in the vertical-wheel bioreactor. An in-vessel dissociation protocol was developed through the testing of various proteolytic enzymes and agitation exposure times. RESULTS: CFD modeling demonstrated the unique flow pattern and homogeneous distribution of hydrodynamic forces produced in the vertical-wheel bioreactor, making it the opportune environment for systematic bioprocess optimization of hiPSC expansion. We developed a scalable, single-cell inoculation protocol for the culture of hiPSCs as aggregates in vertical-wheel bioreactors, achieving over 30-fold expansion in 6 days without sacrificing cell quality. We have also provided the first published protocol for in-vessel hiPSC aggregate dissociation, permitting the entire bioreactor volume to be harvested into single cells for serial passaging into larger scale reactors. Importantly, the cells harvested and re-inoculated into scaled-up vertical-wheel bioreactors not only maintained consistent growth kinetics, they maintained a normal karyotype and pluripotent characterization and function. CONCLUSIONS: Taken together, these protocols provide a feasible solution for the culture of high-quality hiPSCs at a clinical and manufacturing scale by overcoming some of the major documented bioprocess bottlenecks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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